Biyolojide araştırma yöntemlerinin listesi - List of research methods in biology
| Bir serinin parçası |
| Biyoloji |
|---|
|
Bu biyolojide araştırma yöntemleri liste çeşitli kullanılan araştırma yöntemleri hakkında makalelere bir indekstir dalları arasında biyolojisi .
Araştırma tasarımı ve analizi
Araştırma tasarımları
| Araştırma tasarımı | Yarar | potansiyel analizi |
|---|---|---|
| Gruplar arası tasarım | Her biri farklı bir test faktörü tarafından aynı anda test edilen iki veya daha fazla denek grubuna sahip deney | Student t testi , Varyans analizi , Mann-Whitney U testi |
| Tekrarlanan ölçü tasarımı | Farklı koşullar altında veya iki veya daha fazla zaman diliminde aynı veya eşleşen denekler üzerinde aynı değişkenin birden fazla ölçümünü içeren bir araştırma tasarımı . | Eşleştirilmiş t testi , Wilcoxon işaretli sıra testi |
Grafikler ve diyagramlar
| analiz | Yarar | Dal |
|---|---|---|
| Doz-yanıt eğrileri | Belirli bir maruz kalma süresinden sonra bir uyarıcıya veya stres etkenine (genellikle bir kimyasal ) maruz kalmanın (veya dozların ) bir fonksiyonu olarak bir organizmanın tepkisinin büyüklüğünü gösteren grafik | fizyoloji |
| elektroensefalogram | Grafik programları gerilim dalgalanmaları kaynaklanan bu iyonik akımı içindeki nöronlar arasında beyin | sinirbilim |
| Elektrokardiyogram | Grafik gerilim elektrik aktivitesi zamana karşı kalp kullanarak elektrotlara deri üzerine yerleştirilir | fizyoloji |
| Manhattan arsa | Çok sayıda veri noktası, çoğu sıfır olmayan genlik ve daha yüksek büyüklük değerleri dağılımı ile verileri görüntülemek için kullanılır. Grafik, önemli SNP'leri görüntülemek için genom çapında ilişkilendirme çalışmalarında (GWAS) yaygın olarak kullanılır . | Genetik |
| soy çizelgesi | Belirli bir genin veya organizmanın fenotiplerinin ve onun atalarının bir nesilden diğerine, en yaygın olarak insanlardaki fenotiplerinin oluşumunu göstermek için kullanılır , gösteri köpekleri ve yarış atları | Genetik |
| Filogenetik ağaç | Fiziksel veya genetik özelliklerindeki benzerlik ve farklılıklara dayalı olarak çeşitli biyolojik türler veya diğer varlıklar arasındaki evrimsel ilişkileri göstermek için kullanılır. | Sistematik , Evrimsel biyoloji |
| nüfus piramidi | Bir nüfusun (tipik olarak dünyanın bir ülkesinin veya bölgesinin) yaş gruplarına ve cinsiyete göre dağılımını göstermek için kullanılır; nüfus arttığında tipik olarak bir piramit şeklini oluşturur | Popülasyon ekolojisi |
| Punnett karesi | Belirli bir çaprazlama veya üreme deneyinin genotiplerini tahmin etmek için kullanılır | Genetik |
istatistiksel analizler
| analiz | Yarar | Tip |
|---|---|---|
| varyans analizi | Ortalamalar arasındaki farklılıkları analiz etmek için kullanılan istatistiksel modeller ve bunlarla ilişkili tahmin prosedürleri (gruplar arasındaki ve gruplar arasındaki "varyasyon" gibi) topluluğu. | istatistiksel model |
| Ki-kare testi | Test istatistiği, sıfır hipotezi altında ki-kare dağıtıldığında , özellikle Pearson'ın ki-kare testi ve bunun varyantları olduğunda gerçekleştirmek için geçerli olan bir istatistiksel hipotez testi | İstatistiksel hipotez testi |
| Mann-Whitney U testi | Bir istatistiksel hipotez testi arasında boş hipotezinin rastgele seçilen değerler için, bu X ve Y , iki popülasyonlarından, olasılığı X, daha büyük olması avantajlıdır Y olasılığı eşittir Y, daha büyük olması avantajlıdır X | parametrik olmayan istatistikler |
| Öğrenci t-testi | Test istatistiğinin , sıfır hipotezi altında bir Student t- dağılımını takip ettiği herhangi bir istatistiksel hipotez testi | Parametrik istatistikler |
Laboratuvar teknikleri
| Yöntem | Yarar | Şubeler |
|---|---|---|
| Agaroz jel elektroforezi | Agarın iki ana bileşeninden biri olan bir agaroz matrisindeki DNA veya proteinler gibi karışık bir makromolekül popülasyonunu ayırmak için kullanılır | Biyokimya , Moleküler biyoloji , Genetik |
| Hayvan Modeli | İnsanlarda hastalıkları ve bozuklukları araştırmak için kullanılır. Bazı hayvanlar fareler gibi insana benzer özelliklere sahip olabilirken, diğerleri kalamar dev aksonu gibi araştırma için ideal özelliklere sahip olabilir. | Biyokimya , Sinirbilim , Fizyoloji |
| biyolojik ablasyon | Biyolojik bir yapıyı veya işlevi kaldırmak için kullanılır | Genetik , Fizyoloji |
| Kalsiyum görüntüleme | İzole bir hücre , doku veya ortamdaki kalsiyum iyonlarının (Ca 2+ ) durumunu optik olarak ölçmek için kullanılır | fizyoloji |
| hücre izolasyonu | Tek tek canlı hücreleri katı bir doku bloğundan veya hücre süspansiyonundan ayırma işlemi | Hücre Biyolojisi |
| santrifüj | Kullanımı merkezkaç kuvveti , boyut, şekil, yoğunluk, orta viskozitede ve rotor hızına göre bir çözeltiden ayrı parçacıkların | Hücre biyolojisi , Biyokimya |
| CRISPR gen düzenleme | Bakteriyel CRISPR - Cas9 antiviral savunma sisteminin basitleştirilmiş bir versiyonuna dayalı olarak canlı organizmaların genomlarını değiştirmek için kullanılır | Moleküler Biyoloji |
| DNA sıralayıcı | DNA dizileme sürecini otomatikleştirmek için kullanılır | Genetik , Moleküler biyoloji |
| Enzim bağlantılı immünosorbent tahlili (ELISA) | Ölçülecek proteine karşı yönlendirilen antikorlar kullanılarak sıvı bir numunede bir ligandın (genellikle bir protein) varlığını tespit etmek için kullanılır | Biyokimya , Moleküler biyoloji |
| gen nakavt | Bir organizmanın genlerinden birini çalışmaz hale getirmek için kullanılır ("organizmanın devre dışı bırakılması") | Moleküler biyoloji , Genetik |
| bağışıklık kazandırma | Bir numunedeki belirli bir proteini tespit etmek için antikor bazlı bir yöntemin kullanılması | Moleküler biyoloji , Biyokimya |
| hücre içi kayıt | Hücre zarındaki voltajı ölçmek için kullanılır | Nörobilim , Elektrofizyoloji |
| mikrodizi | Deneyler (testleri) büyük miktarlarda biyolojik madde kullanılarak yüksek verimli tarama çoğullanır küçültülmüş ve paralel işleme ve tespit yöntemleri | Genetik , Moleküler biyoloji |
| Mikroelektrot dizisi | Sinir sinyallerinin elde edildiği veya iletildiği çoklu (onlarca ila binlerce) mikro elektrot içeren , esasen nöronları elektronik devrelere bağlayan sinirsel arayüzler olarak hizmet eden cihazlar | sinirbilim |
| Mikroskop | Çıplak gözle görülemeyecek kadar küçük nesneleri incelemek için kullanılır | Hücre Biyolojisi |
| moleküler klonlama | Rekombinant DNA moleküllerini bir araya getirmek ve konak organizmalar içinde replikasyonlarını yönlendirmek için kullanılır . | Moleküler Biyoloji |
| kuzey lekesi | Bir numunede RNA'nın (veya izole edilmiş mRNA'nın ) saptanmasıyla gen ekspresyonunu incelemek için kullanılır . | Moleküler Biyoloji |
| optogenetik | Işığa duyarlı iyon kanallarını ifade etmek için genetiği değiştirilmiş nöronları kontrol etmek için ışığı kullanır | sinirbilim |
| Osiloskop | Değişen sinyal voltajlarını , genellikle zamanın bir fonksiyonu olarak bir veya daha fazla sinyalin kalibre edilmiş iki boyutlu grafiği olarak grafiksel olarak görüntülemek için kullanılır | Sinirbilim , Fizyoloji |
| Kağıt kromatografisi | Renkli kimyasalları veya maddeleri ayırmak için kullanılır. | Moleküler Biyoloji |
| Yama kelepçe | Bireysel izole edilmiş canlı hücrelerde, doku bölümlerinde veya hücre zarı yamalarında iyonik akımları incelemek için kullanılır | Elektrofizyoloji , Sinirbilim |
| Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) | Belirli bir DNA örneğinin milyonlarca ila milyarlarca kopyasını (tam kopyalar veya kısmi kopyalar) hızla yapmak için kullanılır, bu da bilim adamlarının çok küçük bir DNA örneğini almasına ve onu (veya bir kısmını) üzerinde çalışmak için yeterince büyük bir miktara yükseltmesine olanak tanır. detay | Genetik , Moleküler biyoloji |
| Somatik hücre nükleer transferi | Bir vücut hücresinden ve bir yumurta hücresinden canlı bir embriyo oluşturmak için kullanılır | Gelişimsel Biyoloji |
| Güney lekesi | DNA örneklerinde spesifik DNA dizisini tespit etmek için kullanılır | Moleküler Biyoloji |
| Test çapraz | Bir bireyin homozigot mu yoksa heterozigot baskın mı olduğunu belirlemek için kullanılır | Genetik |
| Gerilim kelepçesi | Ölçmek için kullanılır iyon akımları yoluyla zarlar gibi uyanlabilir hücrelerin nöronların membran tutarken, voltaj belirlenmiş bir seviyede. | Fizyoloji , Sinirbilim |
| Batı lekesi | Kullanılan analitik teknik olarak moleküler biyoloji ve immünogenetik belirli tespit etmek için proteinlerin doku homojenatının veya ekstraktın, bir numunede | Moleküler Biyoloji |
| X-ışını kristalografisi | Bir atomik ve moleküler yapısını belirlemek için kullanılan kristal kristal yapısının gelen bir ışın sebep olan, X-ışınları için yaymak çok özel yöne | yapısal biyoloji |
saha teknikleri
| Yöntem | Yarar | Şubeler |
|---|---|---|
| Uzaktan örnekleme | Tahmin etmek için kullanılır yoğunluğu ve / veya bolluğunu ait popülasyonlar | Ekoloji |
| İşaretle ve yeniden yakala | Her bireyi saymanın pratik olmadığı durumlarda bir hayvan popülasyonunun büyüklüğünü tahmin etmek için kullanılır . | Ekoloji |
hesaplama araçları
Matematiksel modeller
| modeli | Yarar | Şubeler |
|---|---|---|
| Üstel entegre ve ateş | Bir veya iki değişkenli, kompakt ve hesaplama açısından verimli doğrusal olmayan spiking nöron modellerini tanımlar | sinirbilim |
| FitzHugh-Nagumo modeli | Uyarılabilir bir sistemin prototipini tanımlar (örneğin, bir nöron ) | sinirbilim |
| Hardy-Weinberg ilkesi | Devletlerin allel bir popülasyonda ve genotip frekansları diğer evrimsel etkiler yokluğunda kuşaktan kuşağa sabit kalacaktır | Genetik , Evrimsel biyoloji |
| Hodgkin-Huxley modeli | Nasıl açıklar aksiyon potansiyelleri de nöronlar başlatılan ve yayılır | sinirbilim |
| Sonsuz siteler modeli | Sonlu bir popülasyonda heterozigotluğun veya genetik çeşitliliğin hesaplanmasına ve ilgili popülasyonlar arasındaki genetik mesafelerin tahmin edilmesine izin verir. | Evrimsel Biyoloji |
| Lojistik büyüme | Bir popülasyonun büyümesini üstel, ardından büyümede bir düşüş ve çevresel baskılar nedeniyle bir taşıma kapasitesine bağlı olarak tanımlar. | Ekoloji |
| Lotka-Volterra denklemleri | Tarif dinamikleri ve biyolojik sistemlerde iki tür etkileşim içinde, bir gibi bir yırtıcı ve yem olarak diğer | Ekoloji |
| Moran süreci | Sonlu popülasyonları tanımlayan stokastik süreç | Genetik |
| Tür-alan ilişkisi | Bir habitatın alanı veya habitatın bir kısmı ile o alanda bulunan türlerin sayısı arasındaki ilişkiyi tanımlar. | Ekoloji |
algoritmalar
| algoritma | Yarar | Şubeler |
|---|---|---|
| evrimsel algoritma | Biyolojik evrimden ilham alan mekanizmaları kullanır . Optimizasyon problemine aday çözümler , popülasyondaki bireylerin rolünü oynar ve uygunluk fonksiyonu , çözümlerin kalitesini belirler. | sinirbilim |