fosfodiester bağı - Phosphodiester bond

Üç nükleotit arasındaki fosfodiester bağlarının (PO 4 3− ) diyagramı . 5' ucu, bir fosfata bağlı 5' karbona sahiptir ve diğer ucu, 3' ucu, bir hidroksil grubuna bağlı bir 3' karbona sahiptir.

Bir fosfodiester bağı tam olarak iki oluşan hidroksil grupları içinde fosforik asit , iki oluşturulması için diğer moleküller üzerindeki hidroksil grupları ile reaksiyona giren ester bağları. "Bağ", bu CO-PO 2 − -OC bağlantısını içerir . Fosfodiesterlerin tartışılması, DNA ve RNA'daki prevalansı tarafından domine edilir , ancak fosfodiesterler, diğer biyomoleküllerde, örneğin asil taşıyıcı proteinlerde meydana gelir .

Fosfodiester bağları, DNA ve RNA'nın omurgasını oluşturur. Fosfat 5' karbona bağlıdır. Bir şekerin 3' karbonu, bitişik şekerin 5' fosfatına bağlanır. Spesifik olarak, fosfodiester bağı , bir şeker molekülünün 3' karbon atomunu ve diğerinin 5' karbon atomunu bağlar (bu nedenle adı, 3', 5' fosfodiester bağı ). Bu sakarit grupları türetilir deoksiriboz DNA ve riboz RNA'da. Fosfodiesterler pH 7'de negatif yüklüdür. Bu negatif yükler arasındaki itme, polinükleik asitlerin yapısını etkiler. Negatif yük histonları , magnezyum gibi metal katyonları ve poliaminleri çeker .

Fosfodiester bağının oluşması ve nükleotitlerin birleşmesi için , nükleotit yapı taşlarının tri-fosfat veya di-fosfat formları parçalanarak enzim katalizli reaksiyonu yürütmek için gereken enerjiyi verir .

Fosfodiester bağlarının hidrolizi, DNA dizilerinin onarımında yer alan fosfodiesterazlar tarafından katalize edilir .

İki ribonükleotit arasındaki fosfodiester bağı , alkalin hidroliz ile kırılabilirken , iki deoksiribonükleotit arasındaki bağlantı bu koşullar altında daha kararlıdır. RNA hidrolizinin göreceli kolaylığı , 2' hidroksil grubunun varlığının bir etkisidir .

Enzim aktivitesi

Bir fosfodiesteraz, örneğin bir siklik AMP veya siklik GMP molekülündeki bir bağ gibi fosfodiester bağlarının hidrolizini katalize eden bir enzimdir .

Oksidatif DNA hasarının onarımında önemli bir rol oynayan bir enzim, 3'-fosfodiesterazdır.

DNA'nın replikasyonu sırasında, DNA polimeraz I tarafından bırakılan omurgada fosfatlar arasında bir delik bulunur . DNA ligaz , nükleotitler arasında bir fosfodiester bağı oluşturabilir.

Ayrıca bakınız

Referanslar