Thomas Cavalier-Smith - Thomas Cavalier-Smith

Thomas Cavalier-Smith
Thomas Cavalier-Smith çizimi.png
Doğmak ( 1942-10-21 )21 Ekim 1942
Londra, Birleşik Krallık
Öldü 19 Mart 2021 (2021-03-19)(78 yaşında)
Milliyet ingiliz
gidilen okul Gonville ve Caius Koleji , Cambridge King's College Londra
Bilinen Cavalier-Smith'in tüm organizmaları sınıflandırma sistemi
Ödüller Royal Society Fellow (1998)
Biyoloji Uluslararası Ödülü (2004) Linnean Madalyası (2007) Frink Madalyası (2007)
Bilimsel kariyer
Alanlar Zooloji
kurumlar King College London , University of British Columbia , Oxford Üniversitesi
Tez Chlamydomonas reinhardii'de Organel Gelişimi (1967)
İnternet sitesi www .zoo .ox .AC .uk / insanlar / görünüm / cavaliersmith _T .htm

Thomas ( Tom ) Cavalier-Smith , FRS , FRSC , NERC Profesörlük Üyesi (21 Ekim 1942 - 19 Mart 2021), Oxford Üniversitesi Zooloji Bölümü'nde Evrimsel Biyoloji Profesörüydü . Araştırmaları, bir dizi tek hücreli organizmanın ( protistler ) keşfedilmesine yol açtı ve krallık Chromista , chromalveolata , Opisthokonta , Rhizaria ve Excavata gibi çeşitli büyük taksonomik grupları savundu . Tüm organizmaları sınıflandırma sistemi ile biliniyordu .

yaşam ve kariyer

Cavalier-Smith, 21 Ekim 1942'de Londra'da doğdu. Ailesi Mary Maude (kızlık soyadı Bratt) ve Alan Hailes Spencer Cavalier Smith idi. Norwich School , Gonville and Caius College, Cambridge (MA) ve King's College London'da (PhD) eğitim gördü . 1964-1967 yılları arasında doktora tezi için Sir John Randall'ın danışmanlığında ; tezi " Chlamydomonas reinhardii'de Organel Gelişimi " başlığını taşıyordu .

1967'den 1969'a kadar Rockefeller Üniversitesi'nde misafir araştırmacı olarak bulundu . 1969'da King's College London'da biyofizik öğretim görevlisi oldu . 1982'de Reader'a terfi etti. 1989'da British Columbia Üniversitesi'nde Botanik Profesörü olarak atandı . 1999 yılında Oxford Üniversitesi'ne katıldı ve 2000 yılında evrimsel biyoloji profesörü oldu.

Ödüller ve onurlar

Cavalier-Smith, 1980'de Linnean Society of London (FLS), 1983'te Biyoloji Enstitüsü (FIBiol ), 1987'de Royal Society of Arts (FRSA ), 1988'de Kanada İleri Araştırma Enstitüsü (CIFAR) Üyesi seçildi. , 1997'de Royal Society of Canada (FRSC) ve 1998'de Royal Society of London . 2004'te Japonya İmparatoru'ndan Uluslararası Biyoloji Ödülü'nü ve 2007'de Linnean Zooloji Madalyası'nı aldı. 1998 ve 2007 yılları arasında Kanada İleri Araştırma Enstitüsü (CIFAR) ve CIFAR Entegre Mikrobiyal Biyoçeşitlilik Danışmanı. O 2007 kazanan Frink Madalyası ait Londra Zooloji Derneği .

Taksonomik Stil

Smith, çoğunlukla mikrobiyal, evrimsel ilişkiler hakkında en üretken fikir kaynağıydı. Yeni ilişkiler önermek için eşsiz bir bilgi zenginliğinden yararlandı. Öneriler, yeni isimleri ilişkilendirdiği veya bazı durumlarda eski isimleri yeniden kullandığı taksonomik kavramlara ve sınıflandırmalara çevrildi.

Smith, disiplinde evrimsel yollar (filojeni) ve bunun sonucunda ortaya çıkan organizmaların sınıflandırılmasıyla ilgili araştırmaları birleştiren farklı bir yol izledi. Sınıflandırmanın evrimsel yolları yansıtması gerektiğine dair yaygın bir varsayımın olduğu bir zamanda çalıştı. Bunun nasıl yapılması gerektiğinin dört büyük etkisi oldu. Birincisi, spekülasyonları kabul eden ve belirli bir evrimsel kavrayışın taksonların düzenine ve sıralarına nasıl çevrilmesi gerektiğine dair herhangi bir açık titizlikten yoksun olan 'geleneksel' yaklaşımın bir kalıntısıydı. Bu yaklaşımın özünde, sıklıkla 'tam öyle' ifadeler olarak reddedilen anlatılar, parafiletik ve polifiletik taksonları içeren ilişkili sınıflandırmalar ve filogenetik ilişkilerden ziyade öznel görüşlerin taksonlara atanan sıralamayı etkileyeceği anlatılar vardı. İkinci etki, bilimsel ilerlemenin nasıl yapıldığına dair felsefeydi. Karl Popper tarafından dile getirilmişti ve vurguyu fikirlerin doğrulanmasından hipotezlerin yanlışlanmasına kaydırmıştı. Popper, bilimin, yanlış hipotezleri ortadan kaldıran bir süreçle ilerlediğini gördü, böylece olası açıklamalar dizisini küçülterek daha doğru olan açıklamalara yol açtı. Bu sürece uyması için hipotezlerin yanlışlanabilir olması gerekiyordu. Üçüncü etki 'kladistik'ti - evrimsel hipotezleri sunmanın (ve ardından tahrif etmenin) açık bir yolu. Bu, başlangıçta Willi Hennig tarafından dile getirildi ve giderek sınıflandırmanın nasıl yapılması gerektiği konusunda pişirildi. Son olarak, dizileme teknolojisindeki teknik ilerlemeler, karşılaştırılan organizmaların dizileri arasındaki benzerliklere dayanan evrimsel ilişkiler hakkında muazzam bir hipotez büyümesine yol açtı. Sıralama verilerini analiz etmek için algoritmalar kullanıldı ve sonuçlar genellikle dendrogramlar şeklinde sunuldu. Bunlar, evrimsel ilişkileri (ağaçlar) göstermek için kullanılan diyagramlarla yüzeysel bir benzerliğe sahiptir ve ne yazık ki 'filogeni' adını almıştır. Moleküler filogenetiğin dendrogramları, seçilen moleküllere, bir analize dahil edilen organizmalara ve karşılaştırmalar yapmak için kullanılan algoritmalara bağlı olarak farklılık gösteriyordu. "Moleküler filogeniler", yanlışlanabilir hipotezler yoluyla ilerleme sürecinin gerektirdiği kesinlikten yoksun olan olasılıksal özetlerdi. Bu "moleküler filogenetiğin" sonucu, sinyali gizleme yeteneğine sahip olan ve çoğu zaman ayrıntılı olarak belirsiz olan bir sürü hipotezdi.

Bilimsel ilerlemenin Popperyan yorumunun baskın olduğu bir zamanda, Smith, Charles Darwin tarafından karakterize edilen, anlatılara dayanan daha önceki gelenekçi üsluba bağlılığı konusunda cesurdu. Bir örnek, klorofil a ve c ile plastidlere sahip soyları birleştiren polifiletik Chromista'yı savunmasıydı (öncelikle krizofitler ve diğer stramenopiller , kriptofitler ve haptofitler). Klorofil ac içeren plastidlerin üç grubun ortak bir atası tarafından edinildiği tek bir endosimbiyotik olay olduğu ve gruplar arasındaki farklılıkların (sitolojik bileşenler ve bunların düzenlemeleri gibi) sonraki evrimsel değişikliklerin sonucudur. Kromistlerin monofiletik olduğuna dair bu yorum, aynı zamanda, üç grubun heterotrofik ( protozoan ) üyelerinin plastidli atalardan ortaya çıkmış olmasını gerektiriyordu. Popperci bir bakış açısından, bu, birçok farklılık nedeniyle yanlışlanmış (geçersiz kılınmış) bir hipotezdi. Alternatif hipotez, üç soyun yakından ilişkili olmadığı (diğer soyların dışlanmasıyla) (yani polifiletikti), muhtemelen hepsinin atasal olarak plastidsiz olduğu ve ayrı simbiyotik olayların klorofil a/c plastidleri stramenopiller, kriptomonadlar ve kriptomonadları oluşturduğuydu. haptofitler. Kromistlerin polifili olduğu sonraki çalışmalarda yeniden ortaya konmuştur. Smith'in test edilebilir filogenetik hipotezler için bir gerekliliği reddetmesi ve evrimsel kavrayışları taksonlara ve hiyerarşik şemalara çevirecek kesin bir metodolojinin yokluğu, istikrarsızlık ve uyumsuzluk kaynaklarıydı. Aşağıda gösterildiği gibi, taksonlarının çoğu, sık sık ayarlanmasını gerektirir. Bu da, taksonomik bir ismin uygulandığı taksonların kapsamı konusunda kafa karışıklığına neden oldu. Smith ayrıca yenilikçi taksonomik kavramlar için tanıdık isimleri (Protozoa gibi) yeniden kullandı. Bu kafa karışıklığı yarattı çünkü Protozoa, yeni anlamlarda kullanımının yanı sıra eski anlamında da kullanılıyordu. Bu durum bir ismin bağlamına atıfta bulunularak çözülebilirdi (yani Protozoa sensu Goldfuß 1818, vs Protozoa sensu Smith 1999 vs Protozoa sensu Smith 2015), ancak böyle bir nüans geniş çapta benimsenmedi. Smith'in vaktinden önce ve yanlışlanamaz içgörüler yayınlama eğilimi, sık sık değişiklik yapma ihtiyacı ve farklı kavramlar için taksonomik isimlerin kullanılması nedeniyle, o, içgörü olduğu kadar bir tartışma kaynağıydı.

Katkılar

Ana maddeler: Cavalier-Smith'in sınıflandırma sistemi ve Krallık (biyoloji)
Cavalier-Smith'ten sonra yaşam ağacı ve hücre evriminde önemli adımlar, ca 2010, 2015 revizyonundan önce

Cavalier-Smith, tüm yaşam formlarının, özellikle de protistlerin taksonomisi ve sınıflandırılması üzerine kapsamlı bir şekilde yazdı . Biyolojiye en büyük katkılarından biri, yeni bir yaşam krallığı önerisiydi : Chromista . Ayrıca Chromalveolata (1981), Opisthokonta (1987), Rhizaria (2002) ve Excavata (2002) adlı ilkel ökaryotlar için yeni bir grup tanıttı . İyi bilinmesine rağmen, iddialarının çoğu tartışmalıdır ve bugüne kadar bilim camiasında yaygın bir kabul görmemiştir . Taksonomik revizyonları genellikle tüm yaşam formlarının genel sınıflandırmasında değişikliklere yol açar.

Sekiz krallık modeli

Cavalier-Smith'in ilk büyük sınıflandırma sistemi, tüm organizmaların sekiz krallığa bölünmesiydi. 1981'de Robert Whittaker'in Beş Krallık sistemini tamamen revize ederek sekiz krallık olabileceğini önerdi: Bacteria, Eufungi, Ciliofungi, Animalia, Biliphyta, Viridiplantae, Cryptophyta ve Euglenozoa.

1993 yılında özellikle Arkebakterilerin Bakterilerden ayrı bir grup olarak genel kabul görmesi ışığında sistemini revize etti. Ek olarak, mitokondriden yoksun bazı protistler keşfedildi. Mitokondrinin bir proteobakteri endosimbiyozunun sonucu olduğu bilindiğinden , bu amitokondriat ökaryotlarının ilkel olarak öyle olduğu düşünüldü ve ökaryotogenezde önemli bir adıma işaret edildi . Sonuç olarak, bu amitokondri protistler protist krallıktan ayrılarak, aynı zamanda süper krallık ve krallık Archezoa'ya yol açtı . Bu, Archezoa hipotezi olarak biliniyordu . Sekiz krallık: Eubacteria, Archaebacteria, Archezoa, Protozoa, Chromista, Plantae, Fungi ve Animalia oldu.

Ancak, krallık Archezoa artık feshedildi. Archezoa krallığının eski üyelerini Amoebozoa filumuna atadı.

Altı krallık modelleri

1998'de Cavalier-Smith toplam krallık sayısını sekizden altıya indirdi : Animalia , Protozoa , Fungi , Plantae (Glaucophyte, kırmızı ve yeşil algler dahil ), Chromista ve Bacteria. Bununla birlikte, bu basitleştirilmiş şemayı ilk kez 1981 tarihli makalesinde sunmuş ve 1983'te onaylamıştır.

Tablo 11 Ökaryot krallıklarından: yedi mi dokuz mu?

Cavalier-Smith'in krallıklarından beşi , aşağıdaki şemada gösterildiği gibi ökaryotlar olarak sınıflandırılır :

  • öbakteriler
  • Neomura
    • arkebakteriler
    • ökaryotlar

: Krallık Animalia dört subkingdoms bölündü RADİATA (filum Porifera , Cnidaria , placozoa ve Ctenophora ), Myxozoa , Mesozoa ve Bilateria (diğer tüm hayvan filumları).

Üç yeni hayvan fila oluşturuldu: Acanthognatha ( rotiferler , acanthocephalans , gastrotrichs ve Çeneli solucanlar ), Brachiozoa ( brakiyopod ve phoronids ) ve Lobopoda ( onychophorans ve su ayıları ) ve 23 hayvan şubelerinin toplam tanıdı.

Cavalier-Smith'in 2003 sınıflandırma şeması:

Yedi krallık modeli

Cavalier-Smith ve işbirlikçileri, 2015 yılında sınıflandırmayı revize etti ve PLOS ONE'da yayınladı . Bu şemada, prokaryotların Bacteria (=Eubacteria) ve Archaea (=Archebacteria) olmak üzere iki krallığa bölünmesini yeniden sundular. Bu, Bakteri ve Arkelerin Taksonomik Anahattı (TOBA) ve Yaşam Kataloğu'ndaki fikir birliğine dayanmaktadır .

Hayat ağacının köklenmesi

2006'da Cavalier-Smith , tüm yaşamın son evrensel ortak atasının , iki zarlı flagellat olmayan bir negibakteri olduğunu öne sürdü.

Referanslar

Dış bağlantılar