kazı - Excavata

kazı
Geçici aralık: Neoproterozoyik-mevcut
Giardia lamblia.jpg
Giardia lamblia , parazitik bir diplomonad
bilimsel sınıflandırma e
İhtisas: ökaryot
(rütbesiz): Kazılar
( Cavalier-Smith ), 2002
filum
Üç tip kazı hücresi. Üst: Jakobida , 1-çekirdek, 2-ön kamçı, 3- ventral/arka kamçı, 4-ventral besleme oluğu. Orta: Euglenozoa , 1-çekirdek, 2-kamçı cep/rezervuar, 3-dorsal/ön kamçı, 4-ventral/arka kamçı, 5-sitostome/besleme aparatı. Alt: Metamonada , 1-ön kamçı, 2-parabazal gövde, 3-dalgalı zar, 4-arka kamçı, 5-çekirdek, 6- aksostyle .

Excavata , Eukaryota alanına ait tek hücreli organizmaların büyük bir üst grubudur . İlk olarak 1999 yılında Simpson ve Patterson tarafından önerilmiş ve 2002 yılında Thomas Cavalier-Smith tarafından resmi bir takson olarak tanıtılmıştır . Çeşitli serbest yaşayan ve simbiyotik formları içerir ve ayrıca Giardia ve Trichomonas dahil olmak üzere insanların bazı önemli parazitlerini içerir . Kazıların eskiden artık kullanılmayan Protista krallığına dahil edildiği düşünülüyordu . Kamçı yapılarına göre sınıflandırılırlar ve en temel Kamçılı soy olarak kabul edilirler . Filogenomik analizler , Kazıların üyelerini , hepsi birbiriyle yakından ilişkili olmayan üç farklı gruba ayırdı : Diskobidler , Metamonadlar ve Malawimonadlar . Euglenozoa hariç hepsi fotosentetik değildir.

özellikleri

Çoğu kazı tek hücreli, heterotrofik flagellatlardır. Sadece Euglenozoa fotosentetiktir. Bazılarında (özellikle anaerobik bağırsak parazitleri), mitokondri büyük ölçüde azalmıştır. Bazı kazılar "klasik" mitokondriden yoksundur ve çoğu büyük ölçüde değiştirilmiş formda (örneğin bir hidrojenozom veya mitosom ) bir mitokondriyal organel bulundurmasına rağmen "amitokondriat" olarak adlandırılır . Mitokondrisi olanlar arasında mitokondriyal cristae tübüler, diskoidal veya bazı durumlarda laminer olabilir. Çoğu kazıda iki, dört veya daha fazla kamçı bulunur . Birçoğunun mikrotübüller tarafından desteklenen karakteristik bir üst yapıya sahip göze çarpan bir karın besleme oluğu vardır - bu oluğun "kazılmış" görünümü organizmalara adını verir. Bununla birlikte, bu özelliklerden yoksun çeşitli gruplar, genetik kanıtlara (öncelikle moleküler dizilerin filogenetik ağaçları) dayalı kazılar olarak kabul edilebilir.

Acrasidae Cıvık Mantarlar sınırlı multicellularity sergilemeye sadece kazdıkları vardır. Diğer hücresel sümüksü küfler gibi , hayatlarının çoğunu tek hücre olarak yaşarlar, ancak bazen daha büyük kümeler halinde toplanırlar.

sınıflandırma

Kazılar, şube/sınıf düzeyinde altı ana alt bölüme ayrılmıştır. Bunlar aşağıdaki tabloda gösterilmiştir. Ek bir grup, Malawimonadida (örneğin Malawimonas ), filogenetik kanıtlar belirsiz olsa da, kazılar arasında yer alabilir.

Krallık/Süper Filum şube/sınıf Temsili cins (örnekler) Açıklama
Discoba veya JEH veya Eozoa Tsukubea Tsukubamonas
öglenozoa Euglena Trypanosoma Birçok önemli parazit, plastidleri olan büyük bir grup (kloroplastlar)
Heterolobosea  (Percolozoa) Naegleria , Acrasis Kamçılı ve amoeboid formlar arasında en çok alternatif
Jakobea Jakoba , Reclinomonas Çok gen açısından zengin mitokondriyal genomlara sahip, serbest yaşayan, bazen lorik kamçılılar
Metamonada  veya POD Preaksostyla Oksimonadlar , Trimastix Amitokondriat kamçıları, serbest yaşayan ( Trimastix , Paratrimastix ) veya böceklerin arka bağırsaklarında yaşayan
fornikata Giardia , Carpediemonas Amitokondriat, çoğunlukla ortakyaşamlar ve hayvanların parazitleri.
parabasalia Trikomonas Amitokondriat kamçıları, genellikle böceklerin bağırsak kommensalleri . Bazı insan patojenleri.
Neolouka Malawimonadida Malawimonas

Diskoba veya JEH kanadı

Euglenozoa ve Heterolobosea (Percolozoa) ya da Eozoa (Cavalier-Smith), özellikle yakın akrabaları olduğu görünmektedir, ve diskoit varlığı ile birleşmiş krista olan mitokondri (Superphylum Discicristata ). Discicristata ile Jakobida arasında yakın bir ilişki gösterilmiştir, Jakobida, Jakobida diğer çoğu protist gibi tübüler cristae'ye sahiptir ve bu nedenle görünüşte monofiletik grup için önerilen Discoba takson adı altında birleştirilmiştir .

Metamonadlar

Metamonadlar, klasik mitokondrilerini kaybetmeleri bakımından olağandışıdır - bunun yerine hidrojenozomları , mitozomları veya karaktersiz organelleri vardır. Oksimonad Monocercomonoides'in homolog organellerini tamamen kaybettiği bildirilmektedir.

monofili

Kazı ilişkileri hala belirsizdir; monofiletik bir grup olmamaları mümkündür . Kazılarda monofiletik olan birkaç dal var gibi görünse de, kazıların monofili net olmaktan uzaktır.

Bazı kazılar, kısmen birçok evrim ağacındaki yerleşimlerine dayanarak , genellikle en ilkel ökaryotlar arasında kabul edilir . Bu , diğer canlı ökaryotların atalarını içeren bir parafiletik derece olan kazıların tekliflerini teşvik edebilir . Bununla birlikte, bazı kazıların 'erken dallar' olarak yerleştirilmesi, diğer bazı gruplarda, örneğin microsporidia'da görüldüğü gibi, uzun dal çekiciliğinin neden olduğu bir analiz eseri olabilir .

Malawimonadlar

Malawimonads genellikle bir molekül filogeneze diğer Kazı gruplarına tipik Kazı morfolojisi sayesinde Excavata üyeleri ve filogenetik afinite olduğu kabul edilir. Bununla birlikte, ökaryotlar arasındaki konumları belirsizliğini koruyor.

Ansiromonadlar

Ancyromonad'lar , hücrenin bir tarafında dar bir uzunlamasına oluk bulunan küçük, serbest yaşayan hücrelerdir. Ansiromonad oluğu, "tipik kazıların" (örneğin malawimonadlar, jakobidler, Trimastix , Carpediemonas , Kiperferlia , vb.) aksine "süspansiyonlu besleme" için kullanılmaz . Ancyromonad'lar bunun yerine yüzeylere bağlı prokaryotları yakalar. Ansiromonadların filogenetik yerleşimi tam olarak anlaşılamamıştır (2020'de), ancak bazı filogenetik analizler onları malawimonadların yakın akrabaları olarak yerleştirmektedir. Sonuç olarak, ancyromonadların 'gerçek' kazıların evrimini anlamak için uygun olmaları mümkündür.

kladogram

Burada, çoğunlukla Cavalier-Smith'i takip eden, kazılarda Ökaryot kökü ile Excavata'nın konumlandırılması için önerilen bir kladogram bulunmaktadır.

ökaryot

Tsukubea

Diskristata

öglenozoa

Perkolozoa

ortokaryotlar

Jakobea

neokaryotlar
Skotokaryotlar /

Metamonada

Malawimonas

Sulcozoa / Podiata /

Planomonadida

CRuM'ler

şekilsiz /

amipozoa

obazoa

breviata

apusomonadida

Opisthokonta / Choanozoa

Unikont
Sarkomastigota
Opimoda / Neozoa
kortika /

Arkeplastida

kromist

Hacrobia

SAR

Bikont / Terleme

Bu görüşe göre, excavata oldukça parafiletiktir ve terk edilmesi önerilmektedir. Alternatif görüşte, Discoba, Diphoda'nın geri kalanının kız kardeşidir.

ökaryot
Opimoda

Metamonada

Malawimonas

podiata

CRuM'ler

amorf

amipozoa

obazoa

breviata

apusomonadida

Opisthokonta

difoda
diskoba

Jakobea

Tsukubea

Diskristata

heteroloboza

öglenozoa

Arkeplastida

kriptomonadida

haptofit

SAR

Galeri

Referanslar

Dış bağlantılar