SeqA proteini - SeqA protein

SeqA, C-terminal alanı
PDB 1j3e EBI.jpg
n6-metiladenin-guanin uyumsuz DNA ile kompleks oluşturan E.coli SeqA proteininin kristal yapısı
tanımlayıcılar
Sembol Sıra
Pfam PF03925
InterPro IPR005621
SCOP2 1lrr / KAPSAM / SUPFAM

Olarak moleküler biyoloji SeqA proteini bulunan bakteri ve arkebakteriler . Bu proteinin işlevi DNA replikasyonunda oldukça önemlidir . Protein , Escherichia coli , OriC'de replikasyonun orijininde DNA replikasyonunun başlamasını negatif olarak düzenler . Ek olarak protein, sekestrasyonda başka bir rol oynar. Bu proteinin önemi hayatidir, DNA replikasyonu, hücre bölünmesi ve diğer önemli süreçlerdeki yardımı olmadan gerçekleşemezdi. Bu protein alanının, SeqB gibi diğer proteinleri içeren çok daha büyük bir protein kompleksinin parçası olduğu düşünülmektedir.

İşlev

DNA replikasyonu enerji tüketen bir süreçtir ve bu nedenle bakterilerde süreç yalnızca hücre döngüsündeki belirli bir kontrol noktasında gerçekleşir. Bağlayıcı SeqA bir protein için hemimetilatlı GAİK dizilerinin negatif modülasyonunda önemlidir kromozomal ORIC de başlatılması ve SeqA oluşumunda gerekli odaklarındaki Escherichia coli kromozom segregasyonu .

SeqA tetramerleri , tersine çevrilebilir, konsantrasyona bağlı bir şekilde kümelenebilir veya multimerize olabilir. DNA replikasyonunun kontrolündeki işlevinin yanı sıra, SeqA ayrıca spesifik bir transkripsiyon faktörü olabilir .

Ek olarak, SeqA'nın kromozom organizasyonu ve gen düzenlemesinde de rolü olduğu düşünülmektedir .

yerelleştirme

Hücredeki SeqA'nın çoğu, replikasyon çatalında yeni DNA'ya bağlı bulunur .

Yapı

N terminal alanı

N-terminali domeni, iki katlanmasını alfa sarmalları ve bir beta-iplikçik. Bu protein alanı, multimerizasyona yardımcı olmada hayati öneme sahiptir.

C terminal alanı

C-terminal protein alanı içinde önemli bir role sahip bağlayıcı DNA. OriC'de tamamen metillenmiş ve hemimetillenmiş GATC dizilerine bağlanır. Yapı C-terminal alanı yedi oluşur alfa sarmalları ve üç-şeritli beta-tabaka .

Referanslar

Bu makale, kamu malı Pfam ve InterPro'dan metin içermektedir : IPR005621