TANK bağlayıcı kinaz 1 - TANK-binding kinase 1

TBK1
Mevcut yapılar
PDB	Ortologtur arama: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	4EFO , 4EUT , 4EUU , 4IM0 , 4IM2 , 4IM3 , 4IW0 , 4IWO , 4IWP , 4IWQ
tanımlayıcılar
takma adlar	TBK1 , Tbk1, 1200008B05Rik, AI462036, AW048562, NAK, T2K, FTDALS4, TANK bağlayıcı kinaz 1, IIAE8
Harici kimlikler	OMIM : 604834 MGI : 1929658 HomoloGene : 22742 GeneCards : TBK1
Gen konumu ( İnsan )
Chr.	Kromozom 12 (insan)
Son	64,502.114 baz puan
Gen konumu ( Fare )
Chr.	Kromozom 10 (fare)
Son	121.586.787 baz puan
RNA ifade modeli
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
moleküler fonksiyon	• transferaz aktivitesi ; • nükleotid bağlanması ; • kinaz aktivitesi ; • protein serin/treonin kinaz aktivitesi ; • fosfoprotein bağlanması ; • GO:0001948 protein bağlanması ; • nükleik asit bağlanması ; • ATP bağlanması ; • protein kinaz aktivitesi ; • özdeş protein bağlanması ; • protein fosfataz bağlanması;
Hücresel bileşen	• Sitoplazma ; • sitozolunda ; • endosome membran ; • nükleoplazmanın ; • agrezom;
biyolojik süreç	• fosforilasyon ; • interferon-alfa üretiminin pozitif regülasyonu ; • bağışıklık sistemi süreci ; • virüse yanıt ; • ksenofajinin pozitif regülasyonu ; • gen ekspresyonunun negatif regülasyonu ; • peptidil-serin fosforilasyonunun pozitif regülasyonu ; • TRIF'e bağlı geçiş ücreti benzeri reseptör sinyal yolu ; • tip I interferon üretimi ; • virüse karşı savunma tepkisi ; • peptidil-serin fosforilasyonu ; • nöron ölümünün düzenlenmesi ; • doğuştan gelen bağışıklık tepkisinin aktivasyonu ; • I-kappaB kinaz/NF-kappaB sinyallemesinin pozitif düzenlenmesi ; • tip I interferon üretiminin negatif düzenlenmesi ; • doğuştan gelen bağışıklık tepkisi ; • GO :0022415 viral süreç ; • inflamatuar yanıt ; • I-kappaB kinaz/NF-kappaB sinyali ; • tip I interferon üretiminin pozitif düzenlenmesi ; • RNA polimeraz II tarafından transkripsiyonun pozitif düzenlenmesi ; • dendritik hücre proliferasyonu ; • GO:0051637 Gram pozitif bakteriye karşı savunma yanıtı ; • interferon-beta üretiminin olumlu düzenleme ; • tip düzenlenmesi ben üretiminin interferon ; • positiv e makrootofajinin düzenlenmesi ; • peptidil-treonin fosforilasyonu ; • protein fosforilasyonu ; • sitokin uyarısına hücresel yanıt ; • gen ekspresyonunun düzenlenmesi ; • hücresel metabolik sürecin düzenlenmesi ; • tip I interferon aracılı sinyal yolunun pozitif düzenlenmesi;
	Kaynaklar: Amigo / QuickGO
ortologlar
	29110
	56480
	ENSG000000183735
	ENSMUSG00000020115
	Q9UHD2
	Q9WUN2
	NM_013254
	NM_019786
	NP_037386
	NP_062760
	Vikiveri
İnsan Görüntüle/Düzenle	Fareyi Görüntüle/Düzenle

TBK1 (TANK bağlayıcı kinaz 1) , kinaz aktivitesine sahip bir enzimdir . Spesifik olarak, bir serin / treonin protein kinazıdır. İnsanlarda TBK1 geni tarafından kodlanır . Bu kinaz esas olarak doğuştan gelen bağışıklık antiviral tepkisindeki rolü ile bilinir . Bununla birlikte, TBK1 ayrıca hücre proliferasyonu , apoptoz , otofaji ve anti- tümör bağışıklığını da düzenler . TBK1 aktivitesinin yetersiz düzenlenmesi, otoimmün , nörodejeneratif hastalıklara veya tümörogeneze yol açar .

Faaliyetin yapısı ve düzenlenmesi

TBK1, nükleer faktör kB'yi (NFkB) fosforile eden kanonik olmayan bir IKK kinazdır . Kanonik IKK ile dizi homolojisini paylaşır .

N-son protein içeren kinaz sahası (bölge 9-309) ve ubikitini etki benzeri (bölge 310-385). C-terminali , iki tarafından oluşturulan çift kıvrımlı bir yüzey sunmak yapılar (bölge 407-713) homodimerizasyon .

Otofosforilasyon bir serin homodimerizasyonunu ve ubikitinilasyonu gerektirir 172, lizinlerin 30 ve 401, kinaz aktivitesi için gereklidir.

Sinyal yollarına katılım

TBK1, birçok sinyal yolunda yer alır ve aralarında bir düğüm oluşturur. Bu nedenle, bireysel sinyal yollarına katılımının düzenlenmesi gereklidir. Bu, substratlara konumunu ve erişimini belirlemek için TBK1'in dimerizasyon alanı ile etkileşime giren adaptör proteinler tarafından sağlanır . TANK'a bağlanma, perinükleer bölgede lokalizasyona ve daha sonra tip I interferonların (IFN-I) üretimi için gerekli olan substratların fosforilasyonuna yol açar . Bunun aksine, bağlanma NAP1 ve SINTBAD localisation neden olur ve sitoplazma ve katılımı otofajinin . TBK1 konumunu belirleyen diğer adaptör protein olan BANT . TAPE, TBK1'i endolizozomlara hedefler .

TBK1'e önemli bir ilgi, doğuştan gelen bağışıklıktaki , özellikle de antiviral tepkilerdeki rolünden kaynaklanmaktadır . TBK1, IKK ile gereksiz , ancak TBK1 daha önemli bir rol oynuyor gibi görünüyor. PRR'ler ( örüntü tanıma reseptörleri ) aracılığıyla antiviral sinyallemeyi tetikledikten sonra TBK1 etkinleştirilir. Daha sonra, çekirdeğe yer değiştiren transkripsiyon faktörü IRF3'ü fosforile eder ve IFN-I üretimini teşvik eder. ${\görüntüleme stili \epsilon }$

Kanonik olmayan bir IKK olarak TBK1, kanonik olmayan NFkB yolunda da yer alır. Daha sonra proteazomda işlenen ve bir p52 alt birimi olarak salınan p100/NF-κB2'yi fosforile eder . Bu alt birim RelB ile dimerize olur ve gen ekspresyonuna aracılık eder .

Kanonik NFkB yolunda, proteinlerin NF-kappa-B (NFKB) kompleksi, NFKB'yi sitoplazmada yakalayarak inaktive eden I-kappa-B ( IKB ) proteinleri tarafından inhibe edilir . IKB proteinleri üzerindeki serin kalıntılarının IKB kinazlar tarafından fosforilasyonu, bunların ubiquitination yolu yoluyla yok edilmeleri için işaretler , böylece NFKB kompleksinin aktivasyonuna ve nükleer translokasyonuna izin verir. Bu gen tarafından kodlanan protein, IKB kinazlarına benzer ve belirli büyüme faktörlerine yanıt olarak NFkB aktivasyonuna aracılık edebilir .

TBK1 teşvik otofajiyi patojen ve katılan mitokondriyal açıklık. TBK1, otofaji reseptörlerini ve otofaji aparatının bileşenlerini fosforile eder. Ayrıca, TBK1 hücre proliferasyonu , apoptoz ve glukoz metabolizmasının düzenlenmesinde de rol oynar .

Etkileşimler

TANK bağlayıcı kinaz 1'in aşağıdakilerle etkileşime girdiği gösterilmiştir :

NCK1 ,
TANK ,
TRAF2 ve
TKBBP1 namı diğer SINTBAD

TBK1 aktivasyonu üzerine aktive edilen transkripsiyon faktörleri arasında IRF3 , IRF7 ve ZEB1 bulunur .

Klinik önemi

TBK1 aktivitesinin deregülasyonu ve bu proteindeki mutasyonlar birçok hastalıkla ilişkilidir. TBK1'in hücre hayatta kalmasındaki rolü nedeniyle , aktivitesinin deregülasyonu, tümörogenez ile ilişkilidir . Ayrıca birçok otoimmün (örneğin, romatoid artrit , sempatik lupus ), nörodejeneratif (örneğin, amyotrofik lateral skleroz ) ve infantil (örneğin, herpesviral ensefalit ) hastalıklar vardır.

TBK1'in kaybı, farelerde embriyonik ölümcüllüğe neden olur.

İnhibisyonu IkB kinaz (IKK) ve IKK-ilgili kinazlar, IKBKE tedavisi için bir tedavi seçeneği olarak araştırılmıştır (IKKε) ve kinaz 1 (TBK1) TANK bağlayıcı enflamatuar hastalıklar ve kanser .

Ayrıca bakınız

CGAS–STING sitozolik DNA algılama yolu

Referanslar

daha fazla okuma

Chou MM, Hanafusa H (Mart 1995). "SH3 alanları için yeni bir ligand. Nck adaptör proteini, bir SH3 alanı yoluyla bir serin/treonin kinaza bağlanır" . Biyolojik Kimya Dergisi . 270 (13): 7359-64. doi : 10.1074/jbc.270.13.7359 . PMID 7706279 .
Chen ZJ, Ebeveyn L, Maniatis T (Mart 1996). "Yeni bir ubiquitination-bağımlı protein kinaz aktivitesi ile IkappaBalpha'nın siteye özgü fosforilasyonu" . Hücre . 84 (6): 853-62. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81064-8 . PMID 8601309 . S2CID 112412 .
Zandi E, Chen Y, Karin M (Ağustos 1998). "IKKalpha ve IKKbeta tarafından IkappaB'nin doğrudan fosforilasyonu: serbest ve NF-kappaB-bağlı substrat arasındaki ayrım". Bilim . 281 (5381): 1360–3. doi : 10.1126/science.281.5381.1360 . PMID 9721103 .
Bonnard M, Mirtsos C, Suzuki S, Graham K, Huang J, Ng M, et al. (Eylül 2000). "T2K eksikliği, apoptotik karaciğer dejenerasyonuna ve NF-kappaB'ye bağlı gen transkripsiyonunun bozulmasına yol açar" . EMBO Dergisi . 19 (18): 4976-85. doi : 10.1093/emboj/19.18.4976 . PMC 314216 . PMID 10990461 .
Kishore N, Huynh QK, Mathialagan S, Salon T, Rouw S, Creely D, et al. (Nisan 2002). "IKK-i ve TBK-1, homolog enzim IKK-2'den enzimatik olarak farklıdır: rekombinant insan IKK-i, TBK-1 ve IKK-2'nin karşılaştırmalı analizi" . Biyolojik Kimya Dergisi . 277 (16): 13840–7. doi : 10.1074/jbc.M110474200 . PMID 11839743 .
Chariot A, Leonardi A, Muller J, Bonif M, Brown K, Siebenlist U (Ekim 2002). "TANK adaptörünün I kappa B kinaz (IKK) düzenleyici NEMO ile ilişkilendirilmesi, IKK komplekslerini IKK epsilon ve TBK1 kinazları ile birleştirir" . Biyolojik Kimya Dergisi . 277 (40): 37029–36. doi : 10.1074/jbc.M205069200 . PMID 12133833 .
Li SF, Fujita F, Hirai M, Lu R, Niida H, Nakanishi M (Ocak 2003). "İnsan NAK geninin promotör bölgesinin genomik yapısı ve karakterizasyonu". gen . 304 : 57-64. doi : 10.1016/S0378-1119(02)01179-4 . PMID 12568715 .
Fitzgerald KA, McWhirter SM, Faia KL, Rowe DC, Latz E, Golenbock DT, et al. (Mayıs 2003). "IKKepsilon ve TBK1, IRF3 sinyal yolunun temel bileşenleridir". Doğa İmmünolojisi . 4 (5): 491–6. doi : 10.1038/ni921 . PMID 12692549 . S2CID 19867234 .
Sharma S, tenOever BR, Grandvaux N, Zhou GP, Lin R, Hiscott J (Mayıs 2003). "IKK ile ilgili bir yol yoluyla interferon antiviral tepkisinin tetiklenmesi". Bilim . 300 (5622): 1148–51. Bibcode : 2003Sci...300.1148S . doi : 10.1126/science.1081315 . PMID 12702806 . S2CID 42641584 .
Matsuda A, Suzuki Y, Honda G, Muramatsu S, Matsuzaki O, Nagano Y, et al. (Mayıs 2003). "NF-kappaB ve MAPK sinyal yollarını aktive eden insan genlerinin geniş ölçekli tanımlanması ve karakterizasyonu" . onkogen . 22 (21): 3307–18. doi : 10.1038/sj.onc.1206406 . PMID 12761501 .
Sato S, Sugiyama M, Yamamoto M, Watanabe Y, Kawai T, Takeda K, Akira S (Ekim 2003). IFN-beta (TRIF) indükleyen Toll/IL-1 reseptör alanı içeren adaptör, TNF reseptörü ile ilişkili faktör 6 ve TANK-bağlayıcı kinaz 1 ile birleşir ve iki farklı transkripsiyon faktörünü, NF-kappa B ve IFN-düzenleyici faktörü aktive eder. 3, Toll benzeri alıcı sinyalleşmesinde" . İmmünoloji Dergisi . 171 (8): 4304–10. doi : 10.4049/jimmunol.171.8.4304 . PMID 14530355 .
Fujita F, Taniguchi Y, Kato T, Narita Y, Furuya A, Ogawa T, et al. (Kasım 2003). "NF-kappaB sinyalleşmesini güçlendiren IkappaB kinaz ile ilgili kinazların düzenleyici bir alt birimi olan NAP1'in tanımlanması" . Moleküler ve Hücresel Biyoloji . 23 (21): 7780-93. doi : 10.1128/MCB.23.21.7780-7793.2003 . PMC 207563 . PMID 14560022 .
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, et al. (Şubat 2004). "İnsan TNF-alfa/NF-kappa B sinyal iletim yolunun bir fiziksel ve fonksiyonel haritası". Doğa Hücre Biyolojisi . 6 (2): 97–105. doi : 10.1038/ncb1086 . PMID 14743216 . S2CID 11683986 .
tenOever BR, Sharma S, Zou W, Sun Q, Grandvaux N, Julkunen I, et al. (Ekim 2004). "Veziküler stomatit virüsü enfeksiyonu ile TBK1 ve IKKvarepsilon kinazların aktivasyonu ve interferon antiviral bağışıklığının gelişiminde viral ribonükleoproteinin rolü" . Viroloji Dergisi . 78 (19): 10636-49. doi : 10.1128/JVI.78.19.10636-10649.2004 . PMC 516426 . PMID 15367631 .
Kuai J, Wooters J, Hall JP, Rao VR, Nickbarg E, Li B, et al. (Aralık 2004). "NAK, TNFR1 kompleksine TNFalfa'ya bağlı bir şekilde dahil edilir ve RANTES üretimine aracılık eder: proteomik bir yaklaşımla endojen TNFR ile etkileşime giren proteinlerin tanımlanması" . Biyolojik Kimya Dergisi . 279 (51): 53266-71. doi : 10.1074/jbc.M411037200 . PMID 15485837 .
Buss H, Dörrie A, Schmitz ML, Hoffmann E, Resch K, Kracht M (Aralık 2004). Serin 536'da p65 NF-KB'nin yapıcı ve interlökin-1 ile indüklenebilir fosforilasyonuna, IKB kinaz IKK-α, IKK-β, IKK-ε, TRAF ailesi üyesi ile ilişkili (TANK)-bağlayıcı kinaz 1 dahil olmak üzere çoklu protein kinazlar aracılık eder. (TBK1) ve bilinmeyen bir kinaz ve p65'i TATA bağlayıcı protein ile ilişkili faktör II31 aracılı interlökin-8 transkripsiyonuna çiftler" . Biyolojik Kimya Dergisi . 279 (53): 55633-43. doi : 10.1074/jbc.M409825200 . PMID 15489227 .

Languages

In other projects