İkinci Nesil Multiplex Plus - Second Generation Multiplex Plus
İkinci Nesil Multipleks Plus (SGM Plus) , a, bir DNA profil tarafından geliştirilen sistem Applied Biosystems . Bu güncellenmiş versiyonudur İkinci Nesil Multiplex . SGM Artı tarafından kullanıldı İngiltere Ulusal DNA Veritabanı 1998 yılından bu yana.
Bir SGM Ayrıca profil 10 numara çifti, 10 her biri için bir sayı çiftinin bir listesini içerir genetik işaretleyici cinsiyet testinin sonuçları iki harf (XX ya da XY) ile birlikte. Her numarası çiftinin iki belirtmektedir alel markör için değerler - bir değer hastanın her bir ebeveyni devralınır. İki gen aynı ardından yalnızca tek bir sayı yerine bir çift ise, kaydedilir.
içindekiler
Genetik İşaretleyiciler
Genetik işaretçiler (veya lokuslar SGM Plus kullanılır) hepsi kısa tandem tekrarı (STR). Kullanılan belirteçler: VWA, D8S1179, D21S11, D18S51, TH01 FGA, D3S1358, D16S539, D2S1338 ve D19S433. Bir işaretin tanımı D ile başlar yerlerde, hemen D aşağıdaki basamak belirtmek kromozomu işaretleyici içerir. Örneğin, D21S11 üzerindedir kromozomu 21 . SGM Plus kullanan Amelogenin'den (Amelo) cinsiyet gösteren testi.
SGM Artı işaretleri D3S1358, D16S539, D2S1338 ve D19S433 kullanmadığını SGM içinde SGM farklıdır.
SGM Artı ortak sekiz işaretleri vardır CODIS FGA, TH01, VWA, D3S1358, D8S1179, D16S539, D18S51 ve D21S11. Bu ek markörler D2S1338 ve D19S433 kullanan beş belirteçler CSF1PO, TPOX, D5S818, D7S820, D13S317 kullanmaz olmasıyla CODIS farklıdır.
| Locus Tanımı |
kromozom Yeri |
Ortak Sıra Motif | Alel aralığı |
Boyut Aralığı (bp) |
Boya Etiket |
|---|---|---|---|---|---|
| FGA | 4q28 | (TTTC) 3 TTTT TTCT (CTTT) n- CTCC (TTCC) 2 | 12,2-51,2 | 215-353 | NED |
| TH01 | 11p15.5 | (AATG) n- | 3-14 | 165-204 | NED |
| VWA | 12p12-pter | TCTA (TCTG) 3-4 (TCTA) n- | 10-25 | 157-209 | 5-FAM |
| D2S1338 | 2q35-37.1 | (TGCC) n (TTCC) n- | 15-28 | 289-341 | 5-FAM |
| D3S1358 | 3p | TCTA (TCTG) 1-3 (TCTA) n- | 8-21 | 114-142 | 5-FAM |
| D8S1179 | 8 | (TCTR) n- | 7-20 | 128-172 | JOE |
| D16S539 | 16q24-qter | (AGAT) n- | 5-16 | 234-274 | 5-FAM |
| D18S51 | 18q21.3 | (AGAA) n- | 7-39,2 | 26-345 | JOE |
| D19S433 | 19q12-13.1 | (AAGG) (AAAG) (AAGG) (Tagg) (AAGG) n- | 9-17,2 | 106-140 | NED |
| D21S11 | 21q11.2-q21 | (TCTA) n (TCTG) n [(TCTA) 3 TA (TCTA) 3 TCA (TCTA) 2 TKSA TA] (TCTA) n- | 12-41,2 | 187-243 | JOE |
| Amelogenin'den | X: p22.1-22.3 Hasılat: p11.2 |
- | - | 107 113 | JOE |
Boya etiketleri
primerler elektroforez altında tespiti için, aşağıdaki floresan boyalar ile etiketlenir:
- 5-FAM
- JOE
- NED
Her bir lokus için primerler büyük moleküler ağırlığa sahip düşük moleküler ağırlığı aşağıdaki sırayla boyalar üzerinde düzenlenir:
- 5-FAM: D3, VWA, D16, D2
- JOE: Amelo, D8, D21, D18
- NED: D19 THO, FGA
Her bir primer, bağlı olduğu boyalar orijinal SGM DNA profil sistemi farklıdır.
Örnek SGM Artı profili
Bir gelen SGM Artı konu GT36865 profili Standartlar ve Teknoloji Ulusal Enstitüsü kağıt aşağıda verilmiştir:
| gezenek | Alel değerler |
|---|---|
| FGA | 22,22 |
| TH01 | 6,7 |
| VWA | 14,16 |
| D2S1338 | 19,24 |
| D3S1358 | 17,17 |
| D8S1179 | 13,14 |
| D16S539 | 9,13 |
| D18S51 | 13,16 |
| D19S433 | 14,15 |
| D21S11 | 30,30 |
| Amelogenin'den | XX |
DNA veritabanından alınan bir SGM Artı profil sadece alel değerlerini listelemek istiyorum:
15,18; 6,9; 11,13; 22,22; 31,32.2; 14,17; 17,20; 11,12; 13,16.3; 15,16; XY
Her bir değer sayısı tandem tekrar allel içinde. Standart dışı tekrar tam tekrar birimlerinin sayısına ve ondalık nokta ile ayrılan kısmi tekrarının baz çifti, sayısı ile gösterilmiştir.
Kimlik olasılığı
(Aynı zamanda rastgele bir maç olasılık olarak da bilinir) tespit ihtimali rastgele seçilmiş iki bireyler aynı genetik profiline sahip olacaktır olasılığıdır.
SGM Artı 3300000000000 Kafkas Amerikalılar 13 Afrikalı-Amerikalılar için trilyonda ve 1 yaklaşık 1 olmak üzere Applied Biosystems kimlik olasılığını tahmin eder.
İnsan Genetiği Komisyonu rastgele maç olasılık trilyonda 1 bölgede olduğunu bildirdi. Ancak SGM Artı profilleme sistemi ilk tanıtıldığında değerini overstating önlemek için, milyarda birinden düşük hukuk mahkemelerinde alıntı olmaz maç olasılıkları ile özdeşleşmeler bilimsel topluluk içinde uyum sağlanmadığı" belirtti DNA delilleri olasılıkları yalnızca tahminidir maç dikkate almak ve kullanılan figür uzman olmayanlar anlamlıydı biriydi emin olmak için."
UK Kraliyet Savcılık Servisi SGM Artı DNA profilleme bireyler arasında çok ayrımcılık olduğunu" belirtiyor. Tesadüfen iki ilgisiz kişilerin profilleri arasında bir eşleşme elde etme ihtimali milyarda 1'in düzeni [bu bir İngiliz unutmayın ki, çok düşüktür milyar , bir ABD trilyon] yani. Ancak, henüz bu maç olasılığını alıntı edebilmek için gerekli istatistik testlerin yapılması mümkün olmamıştır ve pratikte 1.000 milyon 1'lik bir daha muhafazakar şans maç rakam kullanılır."