fikobilizom - Phycobilisome
| fikobilizom proteini | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Bir fikobilizomda protein alt birimlerinin düzeni.
| |||||||||
| tanımlayıcılar | |||||||||
| Sembol | fikobilizom | ||||||||
| Pfam | PF00502 | ||||||||
| InterPro | IPR012128 | ||||||||
| SCOP2 | 1cpc / KAPSAM / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Phycobilisomes olan ışık hasat antenler arasında fotosistem II de siyanobakteri , kırmızı alg ve glaucophytes . Bu kayboldu plastidlerin ait yeşil algler / bitkiler ( kloroplast ).
Genel yapı
Fikobilizomlar, tilakoid zarlara sabitlenmiş protein kompleksleridir (600'e kadar polipeptit ) . Kromoforillenmiş protein yığınlarından , fikobiliproteinlerden ve bunlarla ilişkili bağlayıcı polipeptitlerden yapılırlar . Her fikobilizom , istiflenmiş fikosiyanin ve (varsa) fikoeritrin (ler) veya fikoeritrosiyanin disklerinden yapılmış birkaç dışa dönük çubuktan oluşan allofikosiyanin'den yapılmış bir çekirdekten oluşur . Fikobiliproteinler spektral özelliği esas olarak dikte edilir prostetik gruplar doğrusal, tetrapirol olarak bilinen fikobilin içeren fikosiyanobilin , phycoerythrobilin , phycourobilin ve phycobiliviolin . Belirli bir fikobilinin spektral özellikleri, protein ortamından etkilenir.
İşlev
Her fikobiliprotein, görünür ışık aralığında maksimum spesifik bir absorpsiyon ve floresan emisyonuna sahiptir. Bu nedenle, bunların varlığı ve phycobilisomes olan özel düzenleme emme ve ışık enerjisinin tek yönlü aktarımı sağlar klorofil bir fotosistem II. Bu sayede hücreler, klorofilin ulaşamadığı ışığın mevcut dalga boylarından (500-650 nm aralığında) faydalanır ve enerjilerini fotosentez için kullanırlar. Bu, daha uzun dalga boylarına sahip ışığın daha az iletildiği ve bu nedenle doğrudan klorofil için daha az mevcut olduğu su sütununun derinliklerinde özellikle avantajlıdır .
Bir fikobilizomun geometrik düzenlemesi, anten benzeri bir düzenekte çok zariftir. Enerji transferinde %95 verimlilik sağlar .
Evrim ve çeşitlilik
Genel fikobilizom yapısında birçok varyasyon vardır. Şekilleri hemidisoidal (siyanobakterilerde) veya hemiellipsoidal (kırmızı alglerde) olabilir. Fikoeritrin içermeyen türler, çubuk başına en az iki fikosiyanin diskine sahiptir ve bu, maksimum fotosentez için yeterlidir.
Fikobiliproteinlerin kendileri, son derece kısıtlı işlevleri (spesifik dalga boylarının absorpsiyonu ve transferi) nedeniyle çok az dizi evrimi gösterir. Bazı siyanobakteri türlerinde, hem fikosiyanin hem de fikoeritrin mevcut olduğunda, fikobilizom açık renge yanıt olarak önemli bir yeniden yapılanmaya uğrayabilir. Yeşil ışıkta, çubukların distal kısımları, yeşil ışığı daha iyi emen kırmızı renkli fikoeritrin'den yapılmıştır. Kırmızı ışıkta bunun yerini, kırmızı ışığı daha iyi emen mavi renkli fikosiyanin alır. Bu tersine çevrilebilir süreç, tamamlayıcı kromatik adaptasyon olarak bilinir. Siyanobakterilerin fotosentetik sisteminin, çeşitli yapıların (yani thylakoid membran, vb.) bağlantılı olduğu bir parçacık olarak bileşenidir.
Uygulamalar
Fikobilizomlar hızlı floresan , akış sitometrisi , Western blot ve protein mikrodizilerinde kullanılabilir . Bazı phycobilisomes benzer bir absorpsiyon ve emisyon profili Cy5 bunları adı geçen uygulamaların çoğunda kullanılmak üzere izin. Ayrıca 200 kata kadar daha parlak olabilirler ve daha büyük Stokes kayması ile bağlanma olayı başına daha büyük bir sinyal sağlarlar. Bu özellik, düşük seviyeli hedef moleküllerin]\ veya nadir olayların tespit edilmesini sağlar.
Mavi-yeşil bir algden bir fikobilizomun uyarılma ve emisyon spektrumları.
Western blot uygulamasında fikobilizoma karşı siyanin boya saptama yetenekleri.
Referanslar
Dış bağlantılar
- ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi'ndeki Fikobilizomlar Tıbbi Konu Başlıkları (MeSH)
- Columbia Biosciences - Phycobilisome Kaynak