SPI1 - SPI1

SPI1
Mevcut yapılar
PDB	Ortologtur arama: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	1PUE
tanımlayıcılar
takma adlar	SPI1 , OF, PU.1, SFPI1, SPI-1, SPI-A, Spi-1 proto-onkogen
Harici kimlikler	OMIM : 165170 MGI : 98282 HomoloGene : 2346 GeneCards : SPI1
Gen konumu ( İnsan )
Chr.	Kromozom 11 (insan)
Son	47.378.547 baz puan
Gen konumu ( Fare )
Chr.	Kromozom 2 (fare)
Son	91.115.756 baz puan
RNA ifade modeli
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
moleküler fonksiyon	• DNA bağlama ; • diziye özgü DNA bağlama ; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA bağlama transkripsiyon aktivatör aktivitesi, RNA polimeraz II'ye özgü ; • GO:0000980 RNA polimeraz II cis- düzenleyici bölge sekansına özgü DNA bağlanması ; • transkripsiyon faktörü aktivitesi, RNA polimeraz II çekirdek promotörü proksimal bölge sekansına özel bağlanma ; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA bağlayıcı transkripsiyon baskılayıcı aktivite, RNA polimeraz II'ye özgü ; • GO: 0001948 protein bağlanması ; • RNA bağlanması ; • transkripsiyon faktörü aktivitesi, RNA polimeraz II distal güçlendirici diziye özgü bağlanma ; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-bağlayıcı transkripsiyon faktörü aktivitesi ; • NFAT protein bağlanması ; • GO:0001200 , GO:0001133, GO:0001201 DNA-bağlayıcı transkripsiyon faktörü aktivitesi, RNA polimeraz II-spesifik ; • transkripsiyon faktörü bağlanması;
Hücresel bileşen	• çekirdek ; • nükleoplazma ; • transkripsiyon düzenleyici kompleks;
biyolojik süreç	• miyeloid lökosit farklılaşması ; • transkripsiyonun düzenlenmesi, DNA şablonlu ; • etanole hücresel yanıt ; • somatik kök hücre popülasyonunun korunması ; • lenfosit farklılaşması ; • eritrosit farklılaşmasının düzenlenmesi ; • miyeloid dendritik hücre farklılaşması ; • RNA polimeraz II tarafından transkripsiyonun negatif düzenlenmesi ; • MHC'nin negatif düzenlenmesi sınıf II biyosentetik süreç ; • lenfoid progenitör hücre farklılaşması ; • transkripsiyon, DNA-kalıplı ; • makrofaj farklılaşması ; • anatomik yapı gerilemesi ; • histon H4 asetilasyonunun negatif düzenlenmesi ; • gen ekspresyonunun negatif düzenlenmesi, epigenetik ; • damar gelişimi ; • granülosit farklılaşması ; • kan damarında yer alan apoptotik süreç morfogenez ; • histon H3 asetillenmesi ; • eritrosit farklılaşma ; • hipermetilasyonunun CpG adasının ; • RNA tarafından pri-miRNA transkripsiyon pozitif düzenleme II Polimeraz ; • RNA transkripsiyon pozitif düzenleme II Polimeraz ; • transkripsiyon negatif regülasyonuna, D NA-şablonu ; • transkripsiyon pozitif düzenleme, DNA şablonu ; • RNA polimeraz II, transkripsiyon regülasyonu ; • RNA tarafından pri-MiRNA transkripsiyon II Polimeraz ; • hücre farklılaşmasını ; • sinyal yolunu interleukin-6 dolayımlı;
	Kaynaklar: Amigo / QuickGO
ortologlar
	6688
	20375
	ENSG00000066336
	ENSMUSG00000002111
	P17947
	P17433
	NM_001080547 ; NM_003120
	NM_011355 ; NM_001378898 ; NM_001378899
	NP_001074016 ; NP_003111
	NP_035485 ; NP_001365827 ; NP_001365828
	Vikiveri
İnsan Görüntüle/Düzenle	Fareyi Görüntüle/Düzenle

Transkripsiyon faktörü PU.1 bir olan protein insanlarda tarafından kodlandığını spi1 geni .

İşlev

Bu gen, miyeloid ve B-lenfoid hücre gelişimi sırasında gen ekspresyonunu aktive eden bir ETS alan transkripsiyon faktörünü kodlar. Nükleer protein, hedef genlerin güçlendiricilerinde bulunan PU kutusu olarak bilinen pürinden zengin bir diziye bağlanır ve bunların ekspresyonunu diğer transkripsiyon faktörleri ve kofaktörlerle koordineli olarak düzenler. Protein ayrıca hedef genlerin alternatif eklenmesini de düzenleyebilir. Bu gen için farklı izoformları kodlayan çoklu transkript varyantları bulunmuştur.

Yapı

ETS alanı, PU.1 ve diğer ETS ailesi transkripsiyon faktörlerinin DNA bağlama modülüdür.

Etkileşimler

SPI1'in aşağıdakilerle etkileşime girdiği gösterilmiştir :

FUS ,
GATA2 ,
IRF4 ve
YOK .

Referanslar

daha fazla okuma

Klemsz MJ, McKercher SR, Celada A, Van Beveren C, Maki RA (1990). "Makrofaj ve B hücresine özgü transkripsiyon faktörü PU.1, ets onkogeni ile ilgilidir". Hücre . 61 (1): 113–124. doi : 10.1016/0092-8674(90)90219-5 . PMID 2180582 . S2CID 27819155 .
Nguyen VC, Ray D, Gross MS, de Tand MF, Frézal J, Moreau-Gachelin F (1990). "Kromozom 11, bölge p11.22 üzerinde insan onkogen SPI1'in lokalizasyonu". Hımm. Genet . 84 (6): 542–546. doi : 10.1007/bf00210807 . PMID 2338340 . S2CID 22337200 .
Chen H, Ray-Gallet D, Zhang P, Hetherington CJ, Gonzalez DA, Zhang DE, Moreau-Gachelin F, Tenen DG (1995). "PU.1 (Spi-1), miyeloid hücrelerde ifadesini otomatik olarak düzenler". onkogen . 11 (8): 1549–1560. PMID 7478579 .
Nagulapalli S, Pongubala JM, Atchison ML (1995). "Çoklu proteinler, PU.1 ile fiziksel olarak etkileşime girer. NF-IL6 beta (C/EBP delta, CRP3) ile transkripsiyonel sinerji". J. İmmünol . 155 (9): 4330-4338. PMID 7594592 .
Pongubala JM, Atchison ML (1995). "Aktive edici transkripsiyon faktörü 1 ve siklik AMP yanıt elemanı modülatörü, immünoglobulin kappa 3' arttırıcının aktivitesini modüle edebilir" . J. Biol. Chem . 270 (17): 10304–10313. doi : 10.1074/jbc.270.17.10304 . PMID 7730336 .
Hromas R, Orazi A, Neiman RS, Maki R, Van Beveran C, Moore J, Klemsz M (1993). "ETS onkogen ailesi üyesi PU.1'in hematopoietik soy ve evre kısıtlı ifadesi" . Kan . 82 (10): 2998–3004. doi : 10.1182/kan.V82.10.2998.2998 . PMID 8219191 .
Hagemeier C, Bannister AJ, Cook A, Kouzarides T (1993). "Transkripsiyon faktörü PU.1'in aktivasyon alanı, retinoblastoma (RB) proteinini ve transkripsiyon faktörü TFIID'yi in vitro olarak bağlar: RB, TFIID ve TFIIB'ye sekans benzerliği gösterir" . Proc. Natl. Acad. bilim ABD . 90 (4): 1580–1584. Bibcode : 1993PNAS...90.1580H . doi : 10.1073/pnas.90.4.1580 . PMC 45918 . PMID 8434021 .
Hallier M, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (1996). "Transkripsiyon faktörü Spi-1/PU.1, RNA'yı bağlar ve RNA bağlayıcı protein p54nrb ile etkileşime girer" . J. Biol. Chem . 271 (19): 11177-11181. doi : 10.1074/jbc.271.19.11177 . PMID 8626664 .
Bassuk AG, Anandappa RT, Leiden JM (1997). "Ets ve NF-kappaB/NFAT proteinleri arasındaki fiziksel etkileşimler, T hücrelerinde insan immün yetmezlik virüsü güçlendiricisinin ortak aktivasyonunda önemli bir rol oynar" . J. Virol . 71 (5): 3563–3573. doi : 10.1128/JVI.71.5.3563-3573.1997 . PMC 191503 . PMID 9094628 .
Li SL, Valente AJ, Zhao SJ, Clark RA (1997). "PU.1, miyeloid hücrelerde p47(phox) promotör aktivitesi için esastır" . J. Biol. Chem . 272 (28): 17802-17809. doi : 10.1074/jbc.272.28.17802 . PMID 9211934 .
Tsukada J, Misago M, Serino Y, Ogawa R, Murakami S, Nakanishi M, Tonai S, Kominato Y, Morimoto I, Auron PE, Eto S (1997). "İnsan T-hücresi lösemi virüsü tip I Tax, iki transkripsiyon faktörü, nükleer faktör-interlökin-6 ve Spi-1 ile ilişkilendirme yoluyla insan prointerlökin-1beta geninin promotörünü transaktive eder" . Kan . 90 (8): 3142–3153. doi : 10.1182/kan.V90.8.3142 . PMID 9376596 .
Hallier M, Lerga A, Barnache S, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (1998). "Transkripsiyon faktörü Spi-1/PU.1, potansiyel birleştirme faktörü TLS ile etkileşime girer" . J. Biol. Chem . 273 (9): 4838-4842. doi : 10.1074/jbc.273.9.4838 . PMID 9478924 .
Suzuki S, Kumatori A, Haagen IA, Fujii Y, Sadat MA, Jun HL, Tsuji Y, Roos D, Nakamura M (1998). "İnsan periferik nötrofilleri, monositleri ve B lenfositlerinde gp91(phox) geninin ekspresyonu için temel bir aktivatör olarak PU.1" . Proc. Natl. Acad. bilim ABD . 95 (11): 6085–6090. Bibcode : 1998PNAS...95.6085S . doi : 10.1073/pnas.95.11.6085 . PMC 27589 . PMID 9600921 .
Carrère S, Verger A, Flourens A, Stehelin D, Duterque-Coquillaud M (1998). "Erg proteinleri, Ets ailesinin transkripsiyon faktörleri, iki farklı alan yoluyla homo, heterodimerler ve üçlü kompleksler oluşturur" . onkogen . 16 (25): 3261-3268. doi : 10.1038/sj.onc.1201868 . PMID 9681824 .
Sato M, Morii E, Takebayashi-Suzuki K, Yasui N, Ochi T, Kitamura Y, Nomura S (1999). "Mikroftalmi ile ilişkili transkripsiyon faktörü, PU.1 ve c-Fos ile etkileşime girer: hücre altı lokalizasyonlarının belirlenmesi". Biyokimya. Biyofiz. Araş. komün . 254 (2): 384-387. doi : 10.1006/bbrc.1998.9918 . PMID 9918847 .
Pirinç AL, Zhu AQ, Singh H (1999). "PU.1-Pip (IRF-4) aktivatör komplekslerinin montaj gereksinimleri: kaynaşmış dimerler kullanarak in vivo fonksiyonun engellenmesi" . EMBO J. . 18 (4): 977-991. doi : 10.1093/emboj/18.4.977 . PMC 1171190 . PMID 10022840 .
Yamamoto H, Kihara-Negishi F, Yamada T, Hashimoto Y, Oikawa T (1999). "Transkripsiyon faktörü PU.1 ve koaktivatör CBP arasındaki fiziksel ve fonksiyonel etkileşimler" . onkogen . 18 (7): 1495–1501. doi : 10.1038/sj.onc.1202427 . PMID 10050886 .
Rao S, Matsumura A, Yoon J, Simon MC (1999). "SPI-B, benzersiz bir prolin, serin ve treonin alanı yoluyla transkripsiyonu aktive eder ve PU.1'den DNA bağlama afinitesi farklılıkları sergiler" . J. Biol. Chem . 274 (16): 11115-11124. doi : 10.1074/jbc.274.16.11115 . PMID 10196196 .
Mao S, Frank RC, Zhang J, Miyazaki Y, Nimer SD (1999). "AML1 proteinleri ve bir ETS proteini arasındaki fonksiyonel ve fiziksel etkileşimler, MEF: t(8;21)-pozitif lösemilerin patogenezi için çıkarımlar" . Mol. Hücre. Biol . 19 (5): 3635–3644. doi : 10.1128/mcb.19.5.3635 . PMC 84165 . PMID 10207087 .

Dış bağlantılar

FactorBook PU.1

İnsan kromozomu 11'deki bir gen ile ilgili bu madde bir taslaktır . Vikipedi'yi genişleterek yardımcı olabilirsiniz .

Languages

In other projects