Forminler - Formins

1
tanımlayıcılar
Sembol FMN1
Alt. semboller LD, FMN
NCBI geni 342184
HGNC 3768
OMIM 136535
Referans Sırası NM_001103184
UniProt Q68DA7
Diğer veri
yer Chr. 15 q13-q14
şekil 2
tanımlayıcılar
Sembol FMN2
NCBI geni 56776
HGNC 14074
OMIM 606373
Referans Sırası XM_371352
UniProt Q9NZ56
Diğer veri
yer Chr. 1 q43
Filum boyunca formin proteinlerinin etki alanı yapısı.
Formin Homoloji Bölgesi 1
tanımlayıcılar
Sembol Drf_FH1
Pfam PF06346
InterPro IPR009408
Formin Homoloji 2 Etki Alanı
PDB 1ux4 EBI.jpg
bir formin homoloji-2 alanının kristal yapıları, bağlı bir dimer mimarisini ortaya çıkarır
tanımlayıcılar
Sembol FH2
Pfam PF02181
InterPro IPR015425
AKILLI FH2
SCOP2 1ux5 / KAPSAM / SUPFAM
Şeffaf FH3 Etki Alanı
PDB 1z2c EBI.jpg
rhoc-gmppnp ile kompleks halinde mdia1 gbd-fh3'ün kristal yapısı
tanımlayıcılar
Sembol Drf_FH3
Pfam PF06367
Pfam klanı CL0020
InterPro IPR010472
DRF Otoregülatör Etki Alanı
PDB 2bap EBI.jpg
n-terminal mdia1 armadillo tekrar bölgesinin kristal yapısı ve mdia1 otoregülasyon alanı (baba) ile kompleks halinde dimerizasyon alanı
tanımlayıcılar
Sembol Drf_DAD
Pfam PF06345
InterPro IPR010465
Diyaphanous GTPaz-bağlama Etki Alanı
PDB 1z2c EBI.jpg
rhoc-gmppnp ile kompleks halinde mdia1 gbd-fh3'ün kristal yapısı
tanımlayıcılar
Sembol Drf_GBD
Pfam PF06371
Pfam klanı CL0020
InterPro IPR010473

(Homoloji proteinleri formin) Formins bir grup protein katılan polimerizasyon bir aktin ipliklerin aktin hızlı büyüyen ucu (dikenli ucu) ile ve ortak. Çoğu formin, Rho- GTPase efektör proteinleridir. Forminler, aktin ve mikrotübül hücre iskeletini düzenler ve hücre polaritesi , sitokinez , hücre göçü ve SRF transkripsiyonel aktivitesi gibi çeşitli hücresel fonksiyonlarda yer alır . Forminler, çeşitli sinyal molekülleri ve hücre iskeleti proteinleri ile etkileşime giren çok alanlı proteinlerdir , ancak bazı forminlere çekirdek içinde işlevler atanmıştır .

çeşitlilik

Forminler, incelenen tüm ökaryotlarda bulunmuştur . İnsanlarda 7 alt grupta sınıflandırılan 15 farklı formin proteini bulunmaktadır. Buna karşılık, mayalar sadece 2-3 formin içerir.

Yapı ve etkileşimler

Forminler, üç formin homoloji (FH) alanının (FH1, FH2 ve FH3) varlığı ile karakterize edilir , ancak formin ailesinin üyeleri her üç alanı da içermeyebilir. Ek olarak, genellikle PDZ , DAD, WH2 veya FHA alanları gibi başka alanlar da mevcuttur .

Prolin bakımından zengin içeren proteinlerin çeşitli FH1 alan aracılık eden etkileşimler, aktin bağlayıcı protein profılın , SH3 (Src homoloji 3) alan proteinler ve WW alanı protein. S. cerevisiae forminlerinin aktin çekirdeklenmesini teşvik edici aktivitesi , FH2 alanına lokalize edilmiştir. FH2 alanı, FH2 alanlarının birbirine doğrudan bağlanma yeteneği yoluyla formin proteinlerinin kendi kendine birleşmesi için gereklidir ve ayrıca aktin polimerizasyonunu inhibe etmek üzere hareket edebilir . FH3 alanı daha az iyi korunur ve konjugasyon sırasında forminleri mitotik iğ veya projeksiyon ucu gibi doğru hücre içi konuma yönlendirmek için gereklidir . Ek olarak, bazı formlar, Rho küçük GTPaz'lara bağlanma için gerekli bir GTPaz bağlama alanı ( GBD ) ve bir C-terminali korunan Dia-otoregülatör alanı (DAD) içerebilir . GBD, aktive edilmiş Rho ailesi üyeleri ile etkileşime giren ve onlar tarafından düzenlenen iki işlevli bir oto-inhibitör etki alanıdır. Memeli Drf3 bir beşik benzeri içeren motif bağlanma için GBD içinde Cdc42 activate için Cdc42'ye için gerekli ve doğru Drf3 rehberlik edilir hücre korteksin o aktin iskeleti remodels. DAD, N-terminal GBD'yi bağlar; GTP'ye bağlı Rho, GBD'ye bağlandığında ve proteini aktive ettiğinde bu bağlantı bozulur. DAD'nin memeli hücrelerine eklenmesi, aktin filament oluşumunu indükler , mikrotübülleri stabilize eder ve SRF aracılı transkripsiyonu aktive eder . Yaygın olarak bulunan diğer bir alan, FH3 alanında bulunan bir armadillo tekrar bölgesidir (ARR).

FH2 domeninin, X-ışını kristalografisi ile üç sarmal alt alan içeren uzun, hilal bir şekle sahip olduğu gösterilmiştir .

Forminler ayrıca FH2 alanları aracılığıyla mikrotübüllere doğrudan bağlanır . Bu etkileşim, göç eden hücrelerin ön kenarına doğru yönlendirilmiş bir mikrotübül alt kümesinin yakalanmasını ve stabilizasyonunu teşvik etmede önemlidir. Formins ayrıca tarafından mikrotübüllerin yakalama teşvik kinetokor oluşumunu uyarır sırasında mitoz bölünme ve filamentler aktin birlikte Mikrotübülleri hizalanması için.

Referanslar

Dış bağlantılar

Bu makale, kamuya açık alan Pfam ve InterPro'dan metin içermektedir : IPR010472
Bu makale, kamu malı Pfam ve InterPro'dan metin içermektedir : IPR015425
Bu makale, kamu malı Pfam ve InterPro'dan metin içermektedir : IPR010465
Bu makale, kamu malı Pfam ve InterPro'dan metin içermektedir : IPR010473