Termos termofili -Thermus thermophilus

termofilus
bilimsel sınıflandırma
Krallık:
bakteri
filum:
Deinococcus-Thermus
Sınıf:
Deinokoklar
Emir:
Termaller
Aile:
Termikgiller
cins:
termos
Türler:
T. termofilus
Binom adı
termofilus

Thermus thermophilus , genetik manipülasyon , yapısal genomik ve sistem biyolojisi içinbir model organizma dahil olmak üzere bir dizi biyoteknolojik uygulamada kullanılan Gram negatif bir bakteridir . Bakteri,yaklaşık 65 °C (149 °F)'lik bir optimal büyüme sıcaklığı ileson derece termofiliktir . Thermus thermophilus orjinal içinde termal delik izole edilmiştir sıcak kaynak olarak Ito Tairo Oshima ve Kazutomo Imahori ile, Japonya. Organizmanın ayrıca kompostlaştırmanın termojenik fazında organik maddelerin bozunmasında da önemli olduğu bulunmuştur.. T. thermophilus , laboratuvar ortamlarında en yaygın olarak kullanılan HB8 ve HB27 olmak üzere çeşitli suşlara göre sınıflandırılır. Bu suşların genom analizleri 2004 yılında bağımsız olarak tamamlandı.

Hücre Yapısı

Thermus thermophilus , fosfolipidler ve lipopolisakkaritlerden oluşan bir dış zara sahip Gram negatif bir bakteridir . Bu bakteri ayrıca ince bir peptidoglikan ( murein olarak da bilinir) tabakasına sahiptir, bu tabakada toplam murein tabakasının %85'inden fazlasını oluşturan 29 muropeptid vardır. Bu bakterinin murein tabakasında Ala, Glu, Gly, Orn, N-asetil glukozamin ve N-asetilmuramik varlığı tespit edilmiştir. Bu murein tabakasının bir başka benzersiz özelliği, N-terminal Gly'nin fenilasetik asit ile ikame edilmiş olmasıdır. Bu,bakteri hücrelerinin mureinde bulunan fenilasetik asidin ilk örneğidir. Bu murein tabakasında bulunan bileşim ve peptit çapraz köprüleri, Gram pozitif bakteri için tipiktir, ancak glikan zincirininmiktarı, derecesi ve uzunluğubu bakteriye Gram negatif özelliklerini verir.

Hayatta Kalma Mekanizmaları

Thermus thermophilus aslenJaponya'dabir termal havalandırmada bulundu. Bu bakteriler çeşitli jeotermal ortamlarda bulunabilir. Bu Termofiller, DNA yüksek sıcaklıklarda kararsız hale geldiğinden daha sıkı bir DNA onarım sistemi gerektirir. Bu bakterinin GC içeriği yaklaşık %69'dur, bu bakteri genomunun termostabilitesine katkıda bulunur.

Suşlar

Laboratuvar ortamlarında en yaygın kullanılan iki suş HB27 ve HB8'dir. HB27 suşu, aerobik veya anaerobik bir ortamda yaşayabilir . Bir ana kromozomdan (1.89Mb uzunluğunda) ve ayrıca pTT27 (0.23Mb uzunluğunda) olarak bilinen bir megaplazmitten oluşan bir genoma sahiptir . HB27'nin kromozomu, 1.968 protein kodlayan gen içerir ve bu genlerin %20'si bilinen bir işleve sahip değildir. Megaplazmit 230 protein kodlayan gen içerirken, bu genlerin yaklaşık %39'unun bilinen bir işlevi yoktur.

HB8 suşu aynı zamanda bir aerobik organizmadır ve sistem biyolojisi için bir model organizmadır. Bu sahip genomu da pTT27 (0.26Mb) olarak bilinen bir kromozom (1.85MB), hem de bir megaplasmid, ile birleştirilir (uzun 9.3kb) pTT8 olarak bilinen bir plazmid, aşağıdakilerden oluşan. Bu suşun, kromozom ve megaplazmit kopya sayısı yaklaşık dört ila beş olan bir poliploid organizma olduğu bulundu .

Uygulamalar

Bu organizma, mükemmel bir enzim, daha spesifik olarak termozim kaynağı olduğu için endüstriyel biyoteknolojik alanlar için avantajlı olmuştur. Bu enzimlerden biri rTth DNA polimerazdır.

rTth DNA polimeraz , Thermus thermophilus'tan türetilen , 70-80 °C'de optimal aktiviteye sahip, bazı PCR uygulamalarında kullanılan, rekombinant termostabil bir DNA polimerazdır . Enzim etkin sahip ters transkriptaz mevcudiyetinde aktivitesi manganez . Bu enzim, GC açısından zengin hedeflerin amplifikasyonu ve ham numuneler için faydalıdır. PCR, RT-PCR ve ayrıca primer uzatma uygulamalarında kullanılabilir. Bu polimerazın klinik örneklerde bulunan DNA polimeraz inhibitörlerine karşı dirençli olduğu gösterilmiştir , ayrıca inhibitörlerin varlığında RNA'yı tespit etme kapasitesine de sahiptir . İnhibitörlerin varlığında, bu RNA'yı DNA'yı tespit etme kapasitesi ile karşılaştırılabilir bir seviyede tespit ettiği gösterilmiştir .

Referanslar

Dış bağlantılar