sekestozom 1 - Sequestosome 1

SQSTM1
Mevcut yapılar
PDB	Ortologtur arama: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	1Q02 , 2JY7 , 2JY8 , 2K0B , 2KNV , 4MJS , 4UF8 , 4UF9
tanımlayıcılar
takma adlar	SQSTM1 , A170, OSIL, PDB3, ZIP3, p60, p62, p62B, FTDALS3, Sequestosome 1, NADGP, DMRV
Harici kimlikler	OMIM : 601530 MGI : 107931 HomoloGene : 31202 GeneCards : SQSTM1
Gen konumu ( İnsan )
Chr.	Kromozom 5 (insan)
Son	179.838.078 baz puan
Gen konumu ( Fare )
Chr.	Kromozom 11 (fare)
Son	50.210.827 baz puan
RNA ifade modeli
	; ;
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
moleküler fonksiyon	• protein homodimerizasyon aktivitesi ; • reseptör tirozin kinaz bağlanması ; • çinko iyonu bağlanması ; • SH2 alanı bağlanması ; • metal iyonu bağlanması ; • protein serin/treonin kinaz aktivitesi ; • K63-bağlı poliubikitin modifikasyonuna bağımlı protein bağlanması ; • GO:0001948 protein bağlanması ; • özdeş protein bağlanması ; • protein kinaz bağlanması ; • protein kinaz C bağlanması ; • ubikuitin bağlanması ; • enzim bağlanması ; • ubikuitin protein ligaz bağlanması ; • iyonotropik glutamat reseptörü bağlanması;
Hücresel bileşen	• sitoplazma ; • endozom ; • PML gövde ; • Geç endozom ; • P vücut ; • phagophore Montaj yerine ; • nükleoplazmanın ; • agrezom ; • otofagozom ; • amphisome ; • endoplazmik retikulum ; • cisimcik ; • lizozom ; • Sperm midpiece ; • hücre dışı eksozom ; • GO: 0016023 sitoplazmik vezikül ; • çekirdeği ; • sitosol ; • hücre içi zarla çevrili organel ; • otolizozom ; • mitokondri ; • sarkomer ; • Lewy cisimciği;
biyolojik süreç	• apoptotik süreç ; • protein lokalizasyonu ; • hücre farklılaşması ; • protein fosforilasyonunun pozitif regülasyonu ; • GO:0007243 hücre içi sinyal transdüksiyonu ; • ubikuitine bağımlı protein katabolik proses ; • mitokondri organizasyonunun regülasyonu ; • protein heterooligomerizasyonu ; • bağışıklık sistemi prosesi ; • strese yanıt ; • Ras proteininin regülasyonu sinyal transdüksiyon ; • apoptotik prosesin negatif düzenlenmesi ; • otofajinin ; • endozomal taşıma ; • protein kompleksi stabilite düzenlenmesi ; • mitokondrinin otofajinin ; • apoptotik prosesin pozitif düzenleme ; • I-kappaB düzenlenmesinde kinaz / NF-kappaB sinyal ; • transkripsiyon pozitif düzenleme RNA tarafından II Polimeraz ; • RNA polimeraz II tarafından transkripsiyonun negatif düzenlenmesi ; • protein fosforilasyonu ; • mitofaji ; • mitokondriyal depolarizasyona yanıt ; • makrootofaji ; • endozom organizasyonu ; • sitoplazmanın perinükleer bölgesine protein lokalizasyonu ; • iskemiye yanıt ; • mitokondri organizasyonu ; • agrefaji ; • seçici au tofaji ; • interlökin-1 aracılı sinyal yolu ; • uzun vadeli sinaptik güçlenmenin pozitif regülasyonu ; • plazma zarına protein lokalizasyonunun pozitif regülasyonu;
	Kaynaklar: Amigo / QuickGO
ortologlar
	8878
	18412
	ENSG00000161011 ; ENSG00000284099
	ENSMUSG00000015837
	Q13501
	Q64337
	NM_001142298 ; NM_001142299 ; NM_003900
	NM_001290769 ; NM_011018
	NP_001135770 ; NP_001135771 ; NP_003891
	NP_001277698 ; NP_035148
	Vikiveri
İnsan Görüntüle/Düzenle	Fareyi Görüntüle/Düzenle

Sequestosome-1 a, bir protein , insanlarda tarafından kodlandığını SQSTM1 geni . Diğer bir deyişle , ubikitin-bağlama proteini P62 , bir olduğu otofagozom yük proteininin amaçlar, diğer proteinlerin seçici için buna bağlanan Otofajinin . GATA4 ile etkileşime girerek ve onu bozunma için hedefleyerek, GATA-4 ile ilişkili yaşlanmayı ve yaşlanma ile ilişkili salgı fenotipini engelleyebilir .

Model organizmalar

*Sqstm1* nakavt fare fenotipi
karakteristik	Fenotip
homozigot canlılığı	Normal
Doğurganlık	Normal
Vücut ağırlığı	Normal
Endişe	Normal
nörolojik değerlendirme	Normal
Kavrama gücü	Normal
sıcak tabak	Normal
dismorfoloji	Normal
dolaylı kalorimetri	Normal
Glükoz dayanımı testi	Normal
İşitsel beyin sapı yanıtı	Normal
DEXA	Normal
radyografi	Normal
Vücut ısısı	Normal
Göz morfolojisi	Normal
klinik kimya	Normal
Hematoloji	Anormal
Periferik kan lenfositleri	Normal
mikronükleus testi	Normal
Kalp ağırlığı	Normal
Salmonella enfeksiyonu	Normal
Citrobacter enfeksiyonu	Normal
Tüm testler ve analizler

Model organizmalar , SQSTM1 fonksiyonunun çalışmasında kullanılmıştır. Uluslararası Nakavt Fare Konsorsiyumu programının bir parçası olarak Sqstm1 ^{tm1a(KOMP)Wtsi} adlı koşullu bir nakavt fare hattı oluşturuldu - hayvan hastalık modellerini oluşturmak ve ilgilenen bilim adamlarına dağıtmak için yüksek verimli bir mutajenez projesi.

Silmenin etkilerini belirlemek için erkek ve dişi hayvanlara standart bir fenotipik tarama uygulandı . Homozigot mutant fareler üzerinde yirmi iki test yapıldı ve önemli bir anormallik gözlemlendi: dişilerde , artan kırmızı kan hücresi dağılım genişliği ve artan ortalama trombosit hacmi dahil olmak üzere anormal tam kan sayımı parametreleri vardı .

Etkileşimler

Sequestosome 1'in aşağıdakilerle etkileşime girdiği gösterilmiştir :

Referanslar

daha fazla okuma

Geetha T, Wooten MW (2002). "Ubikuitin bağlayıcı protein p62'nin yapısı ve fonksiyonel özellikleri" . FEBS Let . 512 (1–3): 19–24. doi : 10.1016/S0014-5793(02)02286-X . PMID 11852044 . S2CID 22029085 .
Layfield R, Ciani B, Ralston SH, Hocking LJ, Sheppard PW, Searle MS, Cavey JR (2005). "Kemik Paget hastalığına neden olan SQSTM1'in (p62) UBA alanını etkileyen mutasyonların yapısal ve fonksiyonel çalışmaları". Biyokimya. Soc. trans . 32 (Pt 5): 728–30. doi : 10.1042/BST0320728 . PMID 15493999 .
Michou L, Collet C, Laplanche JL, Orcel P, Cornélis F (2006). "Kemik Paget hastalığının genetiği". Eklem Kemik Omurgası . 73 (3): 243–8. doi : 10.1016/j.jbspin.2005.05.009 . PMID 16574459 .
Park I, Chung J, Walsh CT, Yun Y, Strominger JL, Shin J (1996). "Bir 62-kDa proteininin p56lck'in src homoloji 2 (SH2) alanına fosfotirozinden bağımsız bağlanması ve lck benzersiz N-terminal bölgesinde Ser-59 fosforilasyonu ile düzenlenmesi" . Proc. Natl. Acad. bilim ABD . 92 (26): 12338-42. doi : 10.1073/pnas.92.26.12338 . PMC 40352 . PMID 8618896 .
Iyer N, Reagan MS, Wu KJ, Canagarajah B, Friedberg EC (1996). "İnsan RNA polimeraz II transkripsiyon/nükleotid eksizyon onarım kompleksi TFIIH, nükleotid eksizyon onarım proteini XPG ve Cockayne sendromu grup B (CSB) proteinini içeren etkileşimler". Biyokimya . 35 (7): 2157-67. doi : 10.1021/bi9524124 . PMID 8652557 .
Vadlamudi RK, Joung I, Strominger JL, Shin J (1996). "p56lck'in SH2 bölgesinin fosfotirozinden bağımsız bir ligandı olan p62, yeni bir ubikuitin bağlayıcı protein sınıfına aittir" . J. Biol. Chem . 271 (34): 20235–7. doi : 10.1074/jbc.271.34.20235 . PMID 8702753 .
Marcus SL, Winrow CJ, Capone JP, Rachubinski RA (1996). "Bir p56(lck) ligandı, yetim bir nükleer hormon reseptörünün bir koaktivatörü olarak hizmet eder" . J. Biol. Chem . 271 (44): 27197–200. doi : 10.1074/jbc.271.44.27197 . PMID 8910285 .
Jallal B, Mossie K, Vasiloudis G, Knyazev P, Zachwieja J, Clairvoyant F, Schilling J, Ullrich A (1997). "Reseptör benzeri protein-tirozin fosfataz DEP-1, yapısal olarak bir 64-kDa protein serin/treonin kinaz ile ilişkilidir" . J. Biol. Chem . 272 (18): 12158-63. doi : 10.1074/jbc.272.18.12158 . PMID 9115287 .
Sanchez P, De Carcer G, Sandoval IV, Moscat J, Diaz-Meco MT (1998). "P62 ile etkileşim yoluyla lizozom hedefli endozomlara atipik protein kinaz C izoformlarının lokalizasyonu" . Mol. Hücre. Biol . 18 (5): 3069-80. doi : 10.1128/mcb.18.5.3069 . PMC 110686 . PMID 9566925 .
Vadlamudi RK, Shin J (1998). "Proteazomal olmayan bir multiubikuitin zincir bağlayıcı proteini kodlayan p62 geninin genomik yapısı ve promotör analizi" . FEBS Let . 435 (2–3): 138–42. doi : 10.1016/S0014-5793(98)01021-7 . PMID 9762895 . S2CID 3184369 .
Sanz L, Sanchez P, Lallena MJ, Diaz-Meco MT, Moscat J (1999). "p62'nin RIP ile etkileşimi, atipik PKC'leri NF-kappaB aktivasyonuna bağlar" . EMBO J. . 18 (11): 3044-53. doi : 10.1093/emboj/18.11.3044 . PMC 1171386 . PMID 10356400 .
Stumptner C, Heid H, Fuchsbichler A, Hauser H, Mischinger HJ, Zatloukal K, Denk H (1999). "Hepatoselüler karsinomda intrasitoplazmik hiyalin cisimlerinin analizi. Ana bileşen olarak p62'nin gösterilmesi" . NS. J. Pathol . 154 (6): 1701–10. doi : 10.1016/S0002-9440(10)65426-0 . PMC 1866621 . PMID 10362795 .
Sudo T, Maruyama M, Osada H (2000). "p62, bir p38 MAP kinaz düzenleyicisi olarak işlev görür". Biyokimya. Biyofiz. Araş. komün . 269 (2): 521–5. doi : 10.1006/bbrc.2000.2333 . PMID 10708586 .
Sanz L, Diaz-Meco MT, Nakano H, Moscat J (2000). "Atipik PKC-etkileşimli protein p62, IL-1-TRAF6 yolu ile NF-kappaB aktivasyonunu kanalize eder" . EMBO J. . 19 (7): 1576–86. doi : 10.1093/emboj/19.7.1576 . PMC 310227 . PMID 10747026 .
Wooten MW, Seibenhener ML, Mamidipudi V, Diaz-Meco MT, Barker PA, Moscat J (2001). "Atipik protein kinaz C-etkileşimli protein p62, sinir büyüme faktörü ile NF-kappaB aktivasyonu için bir yapı iskelesidir" . J. Biol. Chem . 276 (11): 7709–12. doi : 10.1074/jbc.C000869200 . PMID 11244088 .
Kuusisto E, Salminen A, Alafuzoff I (2001). "Ubikuitin bağlayıcı protein p62, insan tauopatilerinde ve sinükleinopatilerde nöronal ve glial kapanımlarda bulunur". NöroRapor . 12 (10): 2085–90. doi : 10.1097/00001756-200107200-00009 . PMID 11447312 . S2CID 21272705 .
Laurin N, Brown JP, Lemainque A, Duchesne A, Huot D, Lacourcière Y, Drapeau G, Verreault J, Raymond V, Morissette J (2001). "Kemiğin Paget hastalığı: 5q35-qter ve 5q31'de iki lokusun haritalanması" . NS. J. Hım. Genet . 69 (3): 528-43. doi : 10.1086/322975 . PMC 1235483 . PMID 11473345 .
Chang S, Kim JH, Shin J (2002). "p62, PKCzeta ve PAR-4 ile üçlü bir kompleks oluşturur ve PAR-4 kaynaklı PKCzeta inhibisyonunu antagonize eder". FEBS Let . 510 (1–2): 57–61. doi : 10.1016/S0014-5793(01)03224-0 . PMID 11755531 . S2CID 85579338 .
Feng, Lifeng ve ark. "Tamoksifen, endometriyal hiperplaziyi teşvik etmek için Nrf2'ye bağımlı SQSTM1 transkripsiyonunu aktive eder" Theranostics vol. 7,7 1890-1900. 10 Nisan 2017, doi:10.7150/thno.19135

Languages

In other projects

sekestozom 1 - Sequestosome 1

İçindekiler

Model organizmalar

Etkileşimler

Referanslar

daha fazla okuma