Rous sarkom virüsü -Rous sarcoma virus
| Rous sarkom virüsü | |
|---|---|
Virüs sınıflandırması 
|
|
| (rütbesiz): | Virüs |
| Bölge : | ribovirya |
| Krallık: | paranavir |
| filum: | Artverviricota |
| Sınıf: | revtraviricetes |
| Emir: | orterviraller |
| Aile: | retrovirüsler |
| cins: | Alfaretrovirüs |
| Türler: |
Rous sarkom virüsü
|
Rous sarkom virüsü ( RSV ) ( / r aʊ s / ) bir retrovirüstür ve tanımlanan ilk onkovirüstür . Tavuklarda sarkoma neden olur .
Tüm retrovirüslerde olduğu gibi , konakçı DNA'ya entegrasyondan önce RNA genomunu cDNA'ya ters kopyalar .
Tarih
RSV, 1911'de New York'taki Rockefeller Üniversitesi'nde çalışan Peyton Rous tarafından sağlıklı Plymouth Rock tavuklarına tavuk tümörünün hücresiz ekstraktını enjekte ederek keşfedildi . Ekstraktın onkogenezi indüklediği bulundu . Tümörün bağ dokusundan ( sarkom ) oluştuğu bulundu . Böylece RSV, kanser gelişimini moleküler olarak incelemek için kullanılabilecek ilk onkojenik retrovirüs olarak bilinir hale geldi.
1958'de Harry Rubin ve Howard Temin , tavuk embriyo fibroblastlarının RSV enfeksiyonu ile morfolojik olarak değiştirilebileceği bir tahlil geliştirdi. İki yıl sonra Temin, hücrelerin dönüştürülmüş morfolojisinin, RSV'nin genetik bir özelliği tarafından kontrol edildiği sonucuna vardı. O zamanlar bilinmiyordu, ancak daha sonra src geninin sağlıklı hücrelerde morfolojik dönüşümden sorumlu olduğu belirlendi. 1960'larda iki bulgu ortaya çıktı: replikasyon yetkin izole edilmiş virüsler RSV ile ilişkiliydi, ancak transforme edici değildi ve izole edilmiş bir replikasyon-kusurlu RSV suşu transformasyon yetkindi. Bu iki bulgu, viral replikasyon ve malign transformasyonun RSV'de ayrı süreçler olduğu fikrini doğurdu.
Rous, 1966'daki keşfinin önemi nedeniyle Nobel Fizyoloji veya Tıp Ödülü'ne layık görüldü . Daha sonra, Epstein-Barr virüsü gibi diğer onkojenik insan virüsleri keşfedildi. Ayrıca onkogenler başlangıçta retrovirüslerde ve daha sonra hücrelerde bulundu.
Yapı ve genom
| Retroviral 3'UTR kararlılık öğesi | |
|---|---|
 Rous sarkom virüsü retroviral 3'UTR stabilite elemanının tahmin edilen ikincil yapısı
| |
| tanımlayıcılar | |
| Rfam | RF01417 |
| Diğer veri | |
| RNA tipi | cis-reg |
| PDB yapıları | PDBe |
RSV, bir DNA ara maddesine sahip pozitif sens RNA genomuna sahip sınıf VI zarflı bir virüstür.
RSV'nin dört geni vardır:
- gag - kapsid proteinlerini kodlar
- pol – ters transkriptazı kodlar
- env – zarf genini kodlar
- src – konak hücre proteinlerinde fosfat gruplarını amino asit tirozine bağlayan bir tirozin kinazı kodlar .
RSV genomu, konak genomuna entegrasyonunu ve ayrıca RSV genlerinin aşırı ekspresyonunu sağlayan terminal tekrarlarına sahiptir .
Src geni
Src geni olan onkojenik anormal konakçı hücrelerde kontrolsüz büyümesi tetikler. Keşfedilen ilk retroviral onkogendir. Türler arasında yüksek düzeyde koruma ile hayvanlar aleminde mevcut olduğu bulunan edinilmiş bir gendir .
src geni, RSV tarafından alındı ve genomuna dahil edildi, bu da ona konakçı hücrelerin kontrolsüz mitozunu uyarabilme avantajını vererek, taze enfeksiyon için bol miktarda hücre sağladı .
src geni, RSV proliferasyonu için gerekli değildir, ancak mevcut olduğunda virülansı büyük ölçüde artırır .
Src, hücre büyümesi ve farklılaşmasının düzenlenmesinde rol oynayan bir tirozin kinazdır. Etkinleştirilmesinden ve devre dışı bırakılmasından sorumlu olan bir SH2 ve SH3 alanına sahiptir.
RNA ikincil yapısı
RSV'nin RNA genomu, uzunluğu 5-7 kb arasında değişen ve genellikle onu ökaryotik konak hücre içinde anlamsız aracılı bozunmaya (NMD) yönlendirecek son derece uzun bir 3' UTR içerir . 3'UTR içinde korunmuş bir ikincil yapı elemanı tanımlanmıştır ve Rous Sarkom Virüsü Stabilite Elemanı (RSE) olarak bilinir. Bu elementin, eklenmemiş viral RNA'nın bozulmasını önlediği gösterilmiştir .
RSE öğesi ilk olarak Rous Sarkom Virüsünün genomunda tanımlandı, ancak kuş retrovirüs ailesinde yaygın olarak korunduğu görülüyor. RSE elemanı ~300 bp uzunluğundadır ve gag doğal translasyon sonlandırma kodonunun akış aşağısında bulunur . RSE elementinin ikincil yapısı, RNAse sindirimi ve SHAPE kimya analizi ile belirlenmiştir.
RSV'de tanımlanan diğer elementler, bir primer bağlama bölgesini içerir .
tıkaç proteini
Gag proteinleri, viryon oluşumu ve konakçı hücrenin olgun virüs enfeksiyonu için gereklidir. RSV için gag proteini (Pr76) 701 amino asit içerir . Enfeksiyöz virionda bulunan ürünleri serbest bırakan virüs kodlu proteaz tarafından bölünür. Bu bölünmüş ürünler, yeni hücreleri enfekte etmek için başka yollara girebilen matris (MA), kapsid (CA) ve nükleokapsidi (NC) içerir.
RSV zarfı
RSV'nin bir glikoproteini olan bir zarfı vardır : env. Env, oligomerleri oluşturan glikoproteinler olan gp85 ve gp37'den oluşur. env'nin işlevi, RSV'yi konak hücre reseptörüne bağlamak ve pH'dan bağımsız bir şekilde hedef hücre ile füzyonu indüklemektir. Zarf ekzositoz sırasında elde edilir . Virüs, konak hücreden yeni bir dış zar ile hücreyi terk etmesine izin veren plazma zarını tomurcuklar veya iter.
çoğaltma döngüsü
Hücre girişi
Virüslerin konak hücreye girmesinin iki yolu vardır: hücre reseptör endositozu veya füzyon. Endositoz, virüsün hedef hücre zarı üzerindeki bir reseptörü bağladığı ve virüsün hücre içine alındığı veya hücre içine endositoz yaptığı süreçtir. Endositoz pH bağımsız veya pH bağımlı olabilir. Füzyon, virüs hedef hücre zarı ile birleştiğinde ve genomunu hücreye bıraktığında meydana gelir. RSV, konak hücre zarının füzyonu yoluyla konakçı hücreye girer.
Transkripsiyon
RSV genom transkripsiyonunun gerçekleşmesi için bir primer gereklidir. 4S RNA, RSV için primerdir ve 70S RNA, DNA sentezi için şablon görevi görür. RNA'ya bağımlı bir DNA polimeraz olan ters transkriptaz, viral RNA'yı tam uzunluktaki DNA tamamlayıcısına kopyalar.