nörotrofin-3 - Neurotrophin-3

NTF3
Mevcut yapılar
PDB	Ortologtur arama: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	1B8K , 1BND , 1NT3 , 3BUK
tanımlayıcılar
takma adlar	NTF3 , HDNF, NGF-2, NGF2, NT-3, NT3, nörotrofin 3
Harici kimlikler	OMIM : 162660 MGI : 97380 HomoloGene : 1896 GeneCards : NTF3
Gen konumu ( İnsan )
Chr.	Kromozom 12 (insan)
Son	5.521.536 baz puan
Gen konumu ( Fare )
Chr.	Kromozom 6 (fare)
Son	126.166.910 baz puan
RNA ifade modeli
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
moleküler fonksiyon	• nörotrofin p75 reseptörü bağlanması ; • nörotrofin reseptörü bağlanması ; • kemoatraktan aktivitesi ; • büyüme faktörü aktivitesi ; • sinyal reseptörü bağlanması ; • GO:0001948 protein bağlanması;
Hücresel bileşen	• GO:0016023 sitoplazmik kesecik ; • hücre dışı bölge ; • hücre dışı boşluk ; • sinaptik kesecik ; • akson ; • dendrit;
biyolojik süreç	• apoptotik sürecin düzenlenmesi ; • nöron apoptotik sürecinin negatif düzenlenmesi ; • nöron farklılaşmasının düzenlenmesi ; • protein kinaz B aktivitesinin aktivasyonu ; • nöron projeksiyon morfogenezi ; • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 GTPaz aktivitesinin aktivasyonu ; • reseptör içselleştirmesinin pozitif düzenlenmesi ; • transmembran reseptör protein tirozin kinaz sinyal yolu ; • hücre göçünün pozitif regülasyonu ; • hücre-hücre sinyalizasyonu ; • peptidil-serin fosforilasyonunun pozitif regülasyonu ; • pozitif kemotaksi indüksiyonu ; • peptidil-tirozin fosforilasyonunun negatif regülasyonu ; • hücre popülasyon proliferasyonunun pozitif regülasyonu ; • pozitif düzenleme peptidil-tirosin fosforilasyonunun ; • hücre iskeletinin yeniden organizasyonu aktin pozitif düzenleme ; • sinyal transdüksiyonu ; • pozitif kemotaksis ; • sinir sistemi gelişme ; • alıcı aktivitesinin sinyal düzenlenmesi ; • , fosfolipaz C etkinliğinin pozitif düzenleme ; • fosfatidilinositol 3-kinaz sinyal pozitif düzenleme ; • periferik sinir sistemi gelişimi ; • hafıza ; • sinir gelişimi ; • sinir büyüme faktörü sinyal yolu ; • kimyasal sinaptik iletimin modülasyonu ; • nörotrofin TRK reseptör sinyal yolunun pozitif düzenlenmesi;
	Kaynaklar: Amigo / QuickGO
ortologlar
	4908
	18205
	ENSG00000185652
	ENSMUSG00000049107
	P20783
	P20181
	NM_001102654 ; NM_002527
	NM_001164034 ; NM_001164035 ; NM_008742
	NP_001096124 ; NP_002518
	NP_001157506 ; NP_001157507 ; NP_032768
	Vikiveri
İnsan Görüntüle/Düzenle	Fareyi Görüntüle/Düzenle

Nörotrofin-3 a, proteinin insanlarda tarafından kodlandığını NTF3 geni .

Protein bu gen tarafından kodlanan, NT-3,, a, nörotrofik faktör, NGF (sinir büyüme faktörü), ailede nörotrofinler . Periferik ve merkezi sinir sisteminin belirli nöronları üzerinde aktiviteye sahip olan bir protein büyüme faktörüdür ; mevcut nöronların hayatta kalmasını ve farklılaşmasını desteklemeye yardımcı olur ve yeni nöronların ve sinapsların büyümesini ve farklılaşmasını teşvik eder . NT-3, sinir büyüme faktörü (NGF) ve BDNF'den (Beyin Türevli Nörotrofik Faktör) sonra karakterize edilecek üçüncü nörotrofik faktördü .

İşlev

Memeli beynindeki nöronların büyük çoğunluğu doğum öncesi dönemde oluşturulmuş olsa da , yetişkin beyninin bazı bölümleri nöral kök hücrelerden yeni nöronlar üretme yeteneğini korur ; nörogenez olarak bilinen bir süreç . Nörotrofinler, nörojenezi uyarmaya ve kontrol etmeye yardımcı olan kimyasallardır.

NT-3, reseptör tirozin kinaz nörotrofin reseptörlerinden ikisini ( TrkC ve TrkB - aşağıya bakınız) aktive etme yeteneği göz önüne alındığında, potansiyel olarak uyarabileceği nöron sayısı bakımından benzersizdir .

NT-3 yapma yeteneği olmadan doğan fareler, proprioseptif ve mekanoreseptif duyu nöronlarının alt kümelerinde kayıplara sahiptir .

Hareket mekanizması

NT-3, bu büyüme faktörüne cevap verebilen hücrelerin yüzeyindeki üç reseptörü bağlar:

TrkC ("İz C" olarak telaffuz edilir), görünüşe göre "fizyolojik" reseptördür, çünkü NT-3'e en büyük afiniteyle bağlanır.
Bununla birlikte, NT-3, TrkB olarak adlandırılan TrkC ile ilgili reseptörler aracılığıyla bağlanma ve sinyal verme yeteneğine sahiptir .
Son olarak, NT-3, Trk reseptörlerinin yanı sıra LNGFR ("düşük afiniteli sinir büyüme faktörü reseptörü" için) olarak adlandırılan ikinci bir reseptör tipini de bağlar .

Yüksek afiniteli reseptörler

TrkC bir reseptör tirozin kinazdır (yani hücredeki belirli tirozinler üzerine fosfat moleküllerinin eklenmesine neden olarak hücresel sinyalleşmeyi aktive ederek eylemlerine aracılık eder ).

Yukarıda bahsedildiği gibi, ilgili diğer Trk reseptörleri, TrkA ve TrkB vardır . Ayrıca belirtildiği gibi, yapısal olarak NT-3 ile ilişkili başka nörotrofik faktörler de vardır:

NGF ("Sinir Büyüme Faktörü" için)
BDNF ("Beyin Türetilmiş Nörotrofik Faktör" için)
NT-4 ("Nörotropin-4" için)

TrkB, BDNF, NT-4 ve NT-3'ün etkilerine aracılık ederken, TrkA bağlanır ve NGF tarafından aktive edilir ve TrkC sadece NT-3 tarafından bağlanır ve aktive edilir.

Düşük afiniteli reseptörler

Diğer NT-3 reseptörü, LNGFR , biraz daha az net bir rol oynar. Bazı araştırmacılar, LNGFR'nin nörotrofinler için bir "lavabo" olarak bağlandığını ve hizmet ettiğini göstermiştir.

NT-3'ün kristal yapısı, NT-3'ün etrafında iki glikosile edilmiş p75 LNGFR molekülünün simetrik olarak bağlandığı merkezi bir homodimer oluşturduğunu gösterir . Simetrik bağlanma, NT-3 arayüzleri boyunca gerçekleşir ve merkezde 2:2 ligand-reseptör kümesi ile sonuçlanır.

Hem LNGFR hem de Trk reseptörlerini eksprese eden hücreler, bu nedenle daha yüksek bir aktiviteye sahip olabilir - çünkü daha yüksek bir nörotrofin "mikro konsantrasyonuna" sahiptirler.

Bununla birlikte, LNGFR'nin bir hücreye apoptoz yoluyla ölme sinyali verebileceği de gösterilmiştir - bu nedenle Trk reseptörlerinin yokluğunda LNGFR'yi eksprese eden hücreler, bir nörotrofin varlığında yaşamak yerine ölebilir.

Ayrıca bakınız

Tropomiyosin reseptör kinaz B § Agonistleri

Referanslar

daha fazla okuma

Kalcheim C, Carmeli C, Rosenthal A (1992). "Nörotropin 3, kültürlenmiş nöral krest hücreleri için bir mitojendir" . Proc. Natl. Acad. bilim ABD . 89 (5): 1661–5. Bibcode : 1992PNAS...89.1661K . doi : 10.1073/pnas.89.5.1661 . PMC 48512 . PMID 1542658 .
Özçelik T, Rosenthal A, Francke U (1991). "İnsan ve farede beyin kaynaklı nörotrofik faktör ve nörotrofin-3 genlerinin kromozom haritalaması". genomik . 10 (3): 569–75. doi : 10.1016/0888-7543(91)90437-J . PMID 1889807 .
Hallböök F, Ibáñez CF, Persson H (1991). "Sinir büyüme faktörü ailesinin evrimsel çalışmaları, Xenopus yumurtalığında bol miktarda ifade edilen yeni bir üyeyi ortaya çıkardı". Nöron . 6 (5): 845–58. doi : 10.1016/0896-6273(91)90180-8 . PMID 2025430 . S2CID 17772282 .
Jones KR, Reichardt LF (1990). "Sinir büyüme faktörü ailesinin bir üyesi olan bir insan geninin moleküler klonlanması" . Proc. Natl. Acad. bilim ABD . 87 (20): 8060–4. Bibcode : 1990PNAS...87.8060J . doi : 10.1073/pnas.87.20.8060 . PMC 54892 . PMID 2236018 .
Rosenthal A, Goeddel DV, Nguyen T, et al. (1990). "Yeni bir insan nörotrofik faktörünün birincil yapısı ve biyolojik aktivitesi". Nöron . 4 (5): 767-73. doi : 10.1016/0896-6273(90)90203-R . PMID 2344409 . S2CID 30148948 .
Kaisho Y, Yoshimura K, Nakahama K (1990). "Yeni bir insan nörotrofik faktörünü kodlayan bir cDNA'nın klonlanması ve ifadesi" . FEBS Lett . 266 (1–2): 187–91. doi : 10.1016/0014-5793(90)81536-W . PMID 2365067 . S2CID 7645464 .
Ernfors P, Lee KF, Kucera J, Jaenisch R (1994). "Nörotropin-3 eksikliği, periferik sinir sisteminde eksikliklere ve uzuv proprioseptif afferentlerin kaybına yol açar". Hücre . 77 (4): 503–12. doi : 10.1016/0092-8674(94)90213-5 . PMID 7514502 . S2CID 9072110 .
Robinson RC, Radziejewski C, Stuart DI, Jones EY (1995). "Beyin kaynaklı nörotrofik faktör/nörotropin 3 heterodimerin yapısı". Biyokimya . 34 (13): 4139-46. doi : 10.1021/bi00013a001 . PMID 7703225 .
Hattori M, Nanko S (1995). "Şizofreninin şiddetli formları ile nörotrofin-3 gen varyantının İlişkisi". Biyokimya. Biyofiz. Araş. komün . 209 (2): 513–8. doi : 10.1006/bbrc.1995.1531 . PMID 7733919 .
Tessarollo L, Vogel KS, Palko ME, et al. (1995). "Nörotropin-3 genindeki hedeflenen mutasyon, kas duyusal nöronların kaybına neden olur" . Proc. Natl. Acad. bilim ABD . 91 (25): 11844-8. doi : 10.1073/pnas.91.25.11844 . PMC 45332 . PMID 7991545 .
Ryden M, Ibáñez CF (1996). "trkC tarafından tanınandan farklı tek bir fonksiyonel epitopun aracılık ettiği nörotrofin-3'ün p75LNGFR, TrkA ve TrkB'ye bağlanması" . J. Biol. Chem . 271 (10): 5623–7. doi : 10.1074/jbc.271.10.5623 . PMID 8621424 .
Hui JO, Le J, Katta V, et al. (1996). "İnsan nörotrofin-3: bir tek aşamalı peptit haritalama yöntemi ve rekombinant proteinin tam disülfid karakterizasyonu". J. Protein Chem . 15 (4): 351–8. doi : 10.1007/BF01886861 . PMID 8819011 . S2CID 34957071 .
Donovan MJ, Hahn R, Tessarollo L, Hempstead BL (1996). "Memeli kardiyak gelişiminde nörotrofin 3'ün önemli bir nöronal olmayan fonksiyonunun tanımlanması" . Nat. Genet . 14 (2): 210–3. doi : 10.1038/ng1096-210 . PMID 8841198 . S2CID 9259115 .
Arinami T, Takekoshi K, Itokawa M, et al. (1996). "İlk intronda CA tekrar polimorfizminin ve nörotrofin-3 geninin Gly-63/Glu-63 polimorfizminin şizofreni ile ilişkilerinin bulunamaması". Psikiyatrist. Genet . 6 (1): 13–5. doi : 10.1097/00041444-199621000-00003 . PMID 8925252 . S2CID 42610869 .
Urfer R, Tsoulfas P, O'Connell L, et al. (1998). "Trk reseptörlerinin ikinci immünoglobulin benzeri alanında sinir büyüme faktörü için TrkA ve nörotrofin-3 için TrkC'nin bağlanma bölgesinin yüksek çözünürlüklü haritalanması" . J. Biol. Chem . 273 (10): 5829–40. doi : 10.1074/jbc.273.10.5829 . PMID 9488719 .
Suenaga M, Ohmae H, Tsuji S, et al. (1998). "Agregasyonun baskılayıcı bir ajanı kullanılarak inklüzyon cisimciklerinden rekombinant insan nörotrofin-3'ün renatürasyonu". Biyoteknoloji. Uygulama biyokimya . 28 (2): 119–24. PMID 9756741 .
Hochhaus F, Koehne P, Schäper C, et al. (2003). "Hidrosefali olan çocukların beyin omurilik sıvısında yüksek sinir büyüme faktörü ve nörotrofin-3 seviyeleri" . BMC Pediatri . 1 : 2. doi : 10.1186/1471-2431-1-2 . PMC 57003 . PMID 11580868 .
Kobayashi H, Gleich GJ, Butterfield JH, Kita H (2002). "İnsan eozinofilleri, nörotrofinler üretir ve immünolojik uyaranlarda sinir büyüme faktörü salgılar" . Kan . 99 (6): 2214–20. doi : 10.1182/kan.V99.6.2214 . PMID 11877300 .
Hattori M, Kunugi H, Akahane A, et al. (2002). "Nörotropin-3 geninin promotör bölgesindeki yeni polimorfizmler ve şizofreni ile ilişkileri". NS. J. Med. Genet . 114 (3): 304–9. doi : 10.1002/ajmg.10248 . PMID 11920853 .

Languages

In other projects