TSC1 - TSC1

TSC1
Mevcut yapılar
PDB	Ortologtur arama: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	5EJC , 4Z6Y
tanımlayıcılar
takma adlar	TSC1 , LAM, TSC, tüberoskleroz 1, TSC kompleksi alt birimi 1
Harici kimlikler	OMIM : 605284 MGI : 1929183 HomoloGene : 314 GeneCards : TSC1
Gen konumu ( İnsan )
Chr.	Kromozom 9 (insan)
Son	132.946.874 baz puan
Gen konumu ( Fare )
Chr.	Kromozom 2 (fare)
Son	28.691.167 baz puan
RNA ifade modeli
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
moleküler fonksiyon	• şaperon bağlanması ; • GO:0001948 protein bağlanması ; • protein N-terminal bağlanması ; • Hsp70 protein bağlanması ; • ATPase inhibitör aktivitesi ; • Hsp90 protein bağlanması ; • GTPaz aktive edici protein bağlanması;
Hücresel bileşen	• sitoplazma ; • hücre korteksi ; • büyüme konisi ; • hücre içi zarla çevrili organel ; • lamellipodyum ; • zar ; • aktin filamenti ; • TSC1-TSC2 kompleksi ; • hücre iskeleti ; • sitozol ; • çekirdek ; • sitoplazmanın perinükleer bölgesi ; • lipid damlacığı ; • plazma zarı ; • hücre çıkıntısı ; • protein içeren karmaşık ; • şaperon kompleksi ; • GO:0097483, GO:0097481 postsinaptik yoğunluk;
biyolojik süreç	• çekirdekten rRNA aktarımı ; • hücre döngüsünün düzenlenmesi ; • nöral tüpün kapanması ; • serebral korteks gelişimi ; • hafıza T hücre farklılaşması ; • protein kinaz aktivitesinin düzenlenmesi ; • fokal yapışma düzeneğinin pozitif düzenlenmesi ; • miyelinasyon ; • insülin alıcı sinyal yolunun negatif düzenlenmesi ; • sinaps organizasyonu ; • translasyonun düzenlenmesi ; • hipokampus gelişimi ; • fosfoprotein fosfataz aktivitesinin düzenlenmesi ; • hücre-matriks yapışması ; • potasyum iyonu taşınması ; • adaptif bağışıklık tepkisi ; • protein heterooligomerizasyonu ; • böbrek gelişimi ; • sinir sistemi gelişimi ; • hücre projeksiyon organizasyonu ; • GO:0032861, GO:0032862, GO: 0032856 GTPaz aktivitesinin aktivasyonu ; • fokal yapışma düzeneğinin düzenlenmesi ; • glikoz ithalatı ; • hücre matrisi yapışmasının düzenlenmesi ; • hücre boyutunun negatif düzenlenmesi ; • insüline yanıt ; • kalp kası hücre farklılaşması ; • translasyonun negatif düzenlenmesi ; • hücre popülasyonu proliferasyonunun negatif düzenlenmesi ; • hücresel oksijen-gluya yanıt cose yoksunluğu ; • yetişkin lokomotor davranışı ; • TOR sinyalizasyon olumsuz düzenleme ; • nöron ölümünün düzenlenmesi ; • macroautophagy olumsuz düzenleme ; • nöron projeksiyon gelişiminin olumsuz düzenleme ; • macroautophagy olumlu düzenleme ; • GO: GTPaz aktivitesi 0034259 negatif regülasyonu ; • montaj stres lif düzenlenmesi ; • montaj stres lif pozitif düzenleme ; • oksidatif stres kaynaklı nöron ölümü negatif düzenlenmesi ; • ATPaz aktivitesi negatif düzenlenmesi ; • protein stabilizasyonu;
	Kaynaklar: Amigo / QuickGO
ortologlar
	7248
	64930
	ENSG00000165699
	ENSMUSG00000026812
	Q92574
	Q9EP53
	NM_000368 ; NM_001008567 ; NM_001162426 ; NM_001162427 ; NM_001362177
	NM_022887 ; NM_001289575 ; NM_001289576
	NP_000359 ; NP_001155898 ; NP_001155899 ; NP_001349106
	NP_001276504 ; NP_001276505 ; NP_075025
	Vikiveri
İnsan Görüntüle/Düzenle	Fareyi Görüntüle/Düzenle

Yumrulu skleroz 1 (TSC1) olarak da bilinen, hamartin , a, bir protein , insanlarda tarafından kodlandığını TSC1 geni .

İşlev

TSC1, şaperon Hsp90'ın (ısı şoku proteini-90) ATPaz aktivitesini inhibe eden ve şaperon döngüsünü yavaşlatan bir yardımcı şaperon olarak işlev görür . Tsc1, Tsc2 dahil olmak üzere kinaz ve kinaz olmayan istemcilerin refakatinde Hsp90'ın bir kolaylaştırıcısı olarak işlev görür, bu nedenle proteazomda her yerde bulunmalarını ve bozulmalarını önler. TSC1, TSC2 ve TBC1D7 , TSC kompleksi olarak da bilinen bir çoklu protein kompleksidir. Bu kompleks , mTORC1'in temel bir aktivatörü olan küçük GTPaz Rheb için bir GTPaz aktive edici protein (GAP) olarak işlev görerek mTORC1 sinyalini negatif olarak düzenler . TSC kompleksi, bir tümör baskılayıcı olarak suçlanmıştır .

Klinik önemi

Bu gendeki kusurlar , TSC kompleksinin işlevsel bir bozukluğu nedeniyle tüberoskleroza neden olabilir . TSC1'deki kusurlar ayrıca fokal kortikal displazinin bir nedeni olabilir . TSC1 beyin korunmasında yer olabilir nöronları CA3 bölgesinde hipokampus etkilerinden inme .

Etkileşimler

TSC1'in aşağıdakilerle etkileşime girdiği gösterilmiştir :

AKT1 ,
HSP70
HSP90
NEFL ,
PLK1 ve
TSC2 .

Ayrıca bakınız

tüberoskleroz proteini

Referanslar

daha fazla okuma

Hengstschläger M (Ağustos 2001). "Tüberöz skleroz kompleks genleri: sineklerden insan genetiğine". Dermatolojik Araştırma Arşivleri . 293 (8): 383–6. doi : 10.1007/s004030100250 . PMID 11686512 . S2CID 35702323 .
Ramesh V (Haziran 2003). "Beyinde tüberoskleroz kompleksi (TSC) protein fonksiyonunun Yönleri". Biyokimya Derneği İşlemleri . 31 (Pt 3): 579-83. doi : 10.1042/BST0310579 . PMID 12773159 .
Knowles MA, Hornigold N, Pitt E (Haziran 2003). "Sporadik tümörlerde tüberöz skleroz kompleksi (TSC) geni tutulumu". Biyokimya Derneği İşlemleri . 31 (Pt 3): 597-602. doi : 10.1042/BST0310597 . PMID 12773163 .
Ellisen LW (Kasım 2005). "Stres altında büyüme kontrolü: REDD1-TSC yolu üzerinden mTOR regülasyonu" . Hücre Döngüsü . 4 (11): 1500–02. doi : 10.4161/cc.4.11.2139 . PMID 16258273 .
Jozwiak J, Jozwiak S (Mart 2007). "Dev hücreler: iki vuruşlu yumru oluşumu modeline karşıtlık?". Hücresel ve Moleküler Nörobiyoloji . 27 (2): 251–61. doi : 10.1007/s10571-006-9106-0 . PMID 16897363 . S2CID 31624726 .
Nagase T, Seki N, Ishikawa K, Ohira M, Kawarabayasi Y, Ohara O, Tanaka A, Kotani H, Miyajima N, Nomura N (Ekim 1996). "Tanımlanmamış insan genlerinin kodlama dizilerinin tahmini. VI. Hücre dizisi KG-1 ve beyinden cDNA klonlarının analizi ile elde edilen 80 yeni genin (KIAA0201-KIAA0280) kodlama dizileri" . DNA Araştırması . 3 (5): 321–9, 341–54. doi : 10.1093/dnares/3.5.321 . PMID 9039502 .
van Slegtenhorst M, de Hoogt R, Hermans C, Nellist M, Janssen B, Verhoef S, Lindhout D, van den Ouweland A, Halley D, Young J, Burley M, Jeremiah S, Woodward K, Nahmias J, Fox M, Ekong R, Osborne J, Wolfe J, Povey S, Snell RG, Cheadle JP, Jones AC, Tachataki M, Ravine D, Sampson JR, Reeve MP, Richardson P, Wilmer F, Munro C, Hawkins TL, Sepp T, Ali JB, Ward S, Green AJ, Yates JR, Kwiatkowska J, Henske EP, Short MP, Haines JH, Jozwiak S, Kwiatkowski DJ (Ağustos 1997). "Kromozom 9q34 üzerinde tüberoskleroz geni TSC1'in tanımlanması". Bilim . 277 (5327): 805-8. doi : 10.1126/science.277.5327.805 . PMID 9242607 .
Jones AC, Daniells CE, Snell RG, Tachataki M, Idziaszczyk SA, Krawczak M, Sampson JR, Cheadle JP (Kasım 1997). "Moleküler genetik ve fenotipik analiz, TSC1 ve TSC2 ile ilişkili ailesel ve sporadik tüberoskleroz arasındaki farklılıkları ortaya koymaktadır" . İnsan Moleküler Genetiği . 6 (12): 2155–61. doi : 10.1093/hmg/6.12.2155 . PMID 9328481 .
van Slegtenhorst M, Nellist M, Nagelkerken B, Cheadle J, Snell R, van den Ouweland A, Reuser A, Sampson J, Halley D, van der Sluijs P (Haziran 1998). "Hamartin ve tuberin, TSC1 ve TSC2 gen ürünleri arasındaki etkileşim" . İnsan Moleküler Genetiği . 7 (6): 1053–7. doi : 10.1093/hmg/7.6.1053 . PMID 9580671 .
Plank TL, Yeung RS, Henske EP (Kasım 1998). "Tüberoskleroz 1 (TSC1) geninin ürünü olan Hamartin, tüberin ile etkileşime girer ve sitoplazmik veziküllere lokalize görünüyor". Kanser Araştırması . 58 (21): 4766-70. PMID 9809973 .
Kwiatkowska J, Jozwiak S, Hall F, Henske EP, Haines JL, McNamara P, Braiser J, Wigowska-Sowinska J, Kasprzyk-Obara J, Kısa MP, Kwiatkowski DJ (Temmuz 1998). "TSC1 geninin kapsamlı mutasyon analizi: mutasyon sıklığı, ilişkili özellikler ve penetrasyona ilişkin gözlemler" . İnsan Genetiği Annals . 62 (Pt 4): 277–85. doi : 10.1046/j.1469-1809.1998.6240277.x . PMID 9924605 . S2CID 12987381 .
van Slegtenhorst M, Verhoef S, Tempelaars A, Bakker L, Wang Q, Wessels M, Bakker R, Nellist M, Lindhout D, Halley D, van den Ouweland A (Nisan 1999). "225 tüberoskleroz kompleksi hastasından oluşan bir kohortta TSC1 geninin mutasyonel spektrumu: genotip-fenotip korelasyonu için kanıt yok" . Tıbbi Genetik Dergisi . 36 (4): 285–9. doi : 10.1136/jmg.36.4.285 (31 Mayıs 2021 etkin değil). PMC 1734341 . PMID 10227394 .CS1 bakımı: Mayıs 2021 itibariyle DOI etkin değil ( bağlantı )
Niida Y, Lawrence-Smith N, Banwell A, Hammer E, Lewis J, Beauchamp RL, Sims K, Ramesh V, Ozelius L (2000). "Tüberosklerozlu 126 ilgisiz hastada germ hattı mutasyonları için hem TSC1 hem de TSC2'nin analizi". İnsan Mutasyonu . 14 (5): 412–22. doi : 10.1002/(SICI)1098-1004(199911)14:5<412::AID-HUMU7>3.0.CO;2-K . PMID 10533067 .
Zhang H, Nanba E, Yamamoto T, Ninomiya H, Ohno K, Mizuguchi M, Takeshita K (2000). "Tüberoskleroz kompleksi olan Japon hastalarda TSC1 ve TSC2 genlerinin mutasyonel analizi" . İnsan Genetiği Dergisi . 44 (6): 391–6. doi : 10.1007/s100380050185 . PMID 10570911 .
Nellist M, van Slegtenhorst MA, Goedbloed M, van den Ouweland AM, Halley DJ, van der Sluijs P (Aralık 1999). "Sitozolik tuberin-hamartin kompleksinin karakterizasyonu. Tuberin, hamartin için sitozolik bir şaperondur" . Biyolojik Kimya Dergisi . 274 (50): 35647-52. doi : 10.1074/jbc.274.50.35647 . PMID 10585443 .
Yamashita Y, Ono J, Okada S, Wataya-Kaneda M, Yoshikawa K, Nishizawa M, Hirayama Y, Kobayashi E, Seyama K, Hino O (Ocak 2000). "Tüberosklerozlu Japon hastalarda germ hattı mutasyonları için TSC1 ve TSC2 genlerinin tüm ekzonlarının analizi: 10 mutasyon raporu". Amerikan Tıbbi Genetik Dergisi . 90 (2): 123–6. doi : 10.1002/(SICI)1096-8628(20000117)90:2<123::AID-AJMG7>3.0.CO;2-L . PMID 10607950 .
Lamb RF, Roy C, Diefenbach TJ, Vinters HV, Johnson MW, Jay DG, Salon A (Mayıs 2000). "TSC1 tümör baskılayıcı hamartin, ERM proteinleri ve GTPaz Rho aracılığıyla hücre yapışmasını düzenler". Doğa Hücre Biyolojisi . 2 (5): 281–7. doi : 10.1038/35010550 . PMID 10806479 . S2CID 25353057 .
Miloloza A, Rosner M, Nellist M, Halley D, Bernaschek G, Hengstschläger M (Temmuz 2000). "TSC1 gen ürünü, hamartin, hücre çoğalmasını negatif olarak düzenler" . İnsan Moleküler Genetiği . 9 (12): 1721–7. doi : 10.1093/hmg/9.12.1721 . PMID 10915759 .
Murthy V, Stemmer-Rachamimov AO, Haddad LA, Roy JE, Cutone AN, Beauchamp RL, Smith N, Louis DN, Ramesh V (Mart 2001). "Tüberoskleroz proteinleri tüberin ve hamartinin gelişimsel ifadesi". Açta Nöropatolojik . 101 (3): 202–10. doi : 10.1007/s004010000269 . PMID 11307618 . S2CID 8067136 .
Catania MG, Mischel PS , Vinters HV (Temmuz 2001). "G2/M sikline bağımlı kinaz CDK1 ve düzenleyici siklin A ve B ile hamartin ve tüberin etkileşimi" . Nöropatoloji ve Deneysel Nöroloji Dergisi . 60 (7): 711–23. doi : 10.1093/jnen/60.7.711 . PMID 11444800 .

Dış bağlantılar

Tüberoz Skleroz Kompleksi veya Bourneville Hastalığı üzerine GeneReviews/NIH/NCBI/UW girişi
Bulunan tüm yapısal bilgi genel PDB için Uniprot : Q92574 de (hamartin) PDBe-KB .

Languages

In other projects