Genotip frekansı - Genotype frequency

Popülasyonlardaki genetik çeşitlilik, alellerin sıklığı ile analiz edilebilir ve nicelenebilir . Popülasyon genetiğinin merkezinde iki temel hesaplama vardır : alel frekansları ve genotip frekansları. Bir popülasyondaki genotip sıklığı , belirli bir genotipe sahip bireylerin sayısının popülasyondaki toplam birey sayısına bölümüdür. Olarak nüfus genetik , genotip frekans frekansı veya bir bölümünü (yani, 0 <olan ön nüfusu genotipleri <1).

Alel ve genotip frekansları birbiriyle ilişkili olsa da, bunları açıkça ayırt etmek önemlidir.

Genotip frekansı gelecekte bir kişinin bir hastalığı veya hatta doğum kusuru olduğunu tahmin etmek için ("genomik profilleme" için) de kullanılabilir. Etnik çeşitliliği belirlemek için de kullanılabilir.

Genotip frekansları bir De Finetti diyagramı ile gösterilebilir .

Sayısal örnek

Örnek olarak, aşağıdaki genotiplere sahip 100 saat dörtlü bitkiden ( Mirabilis jalapa ) oluşan bir popülasyonu düşünün :

• AA genotipine sahip 49 kırmızı çiçekli bitki
• Aa genotipine sahip 42 pembe çiçekli bitki
• aa genotipli 9 beyaz çiçekli bitki

Bir diploid tür için alel frekansını hesaplarken , homozigot bireylerin bir alelin iki kopyasına sahip olduğunu , heterozigotların ise yalnızca bir kopyaya sahip olduğunu unutmayın . Örneğimizde, pembe çiçekli 42 heterozigotun her biri a alelinin bir kopyasına sahiptir ve beyaz çiçekli 9 homozigotun her birinin iki kopyası vardır. Bu nedenle, a (beyaz renk alel) için alel frekansı eşittir

${\displaystyle {\begin{hizalı}f({a})&={(Aa)+2\times (aa) \over 2\times (AA)+2\times (Aa)+2\times (aa) }={42+2\times 9 \over 2\times 49+2\times 42+2\times 9}={60 \200'den fazla}=0.3\\\end{hizalı}}}$

Bu sonuç allel sıklığı söyler bir 0.3 olduğunu. Başka bir deyişle, popülasyondaki bu gen için alellerin %30'u a aleldir.

Genotip sıklığını karşılaştırın: şimdi aa homozigotlarının (beyaz çiçekli bitkiler) genotip sıklığını hesaplayalım .

${\displaystyle {\begin{aligned}f({aa})&={9 \üzerinde 49+42+9}={9 \100'ün üzerinde}=0.09=($

Alel ve genotip frekansları her zaman bire (%100) eşittir.

Denge

Hardy-Weinberg yasası nüfus gelişen değilken allel ve genotip frekansları arasındaki ilişkiyi açıklar. Yukarıda ele aldığımız saat dörtlü bitkilerin popülasyonunu kullanarak Hardy-Weinberg denklemini inceleyelim: A
allelinin frekansı p sembolü ve alel a frekansı q ile gösterilirse , o zaman p+q=1 . Örneğin, p = 0,7 ise, q 0,3 olmalıdır. Başka bir deyişle, A'nın alel frekansı %70'e eşitse, alellerin kalan %30'u a olmalıdır , çünkü bunlar birlikte %100'e eşittir.

İki alelde bulunan bir gen için, Hardy-Weinberg denklemi ( p ² ) + (2 pq ) + ( q ² ) = 1 olduğunu belirtir . Bu denklemi çiçek rengi genimize uygularsak, o zaman

${\displaystyle f(\mathbf {AA} )=p^{2}}$ (homozigotların genotip frekansı)

${\displaystyle f(\mathbf {Aa} )=2pq}$ (heterozigotların genotip frekansı)

${\displaystyle f(\mathbf {aa} )=q^{2}}$ (homozigotların genotip frekansı)

Eğer p = 0.7 ve q daha sonra = 0.3,

${\displaystyle f(\mathbf {AA} )=p^{2}}$= (0.7) ² = 0.49

${\displaystyle f(\mathbf {Aa} )=2pq}$ = 2×(0.7)×(0.3) = 0.42

${\displaystyle f(\mathbf {aa} )=q^{2}}$= (0.3) ² = 0.09

Bu sonuç, allel sıklığı takdirde, bize anlatır A % 70, ve alel sıklığı bir % 30, beklenen genotip frekans AA ,% 49 Aa % 42 ve aa % 9'dur.

Referanslar

Notlar

• Brooker R, Widmaier E, Graham L, Stiling P (2011). Biyoloji (2. baskı). New York: McGraw-Hill. ISBN'si 978-0-07-353221-9.