Gamma-150 RNA motifi - Gamma-150 RNA motif

Gama-150 RNA motifi halinde korunmuş olan bir RNA bulunan yapı bakteri sırası içinde Pseudomonadales . Gamma-150 RNA'ları tutarlı bir şekilde 5 'UTR'lerde olmadığından , gamma-150 motifinin kodlamayan bir RNA'ya karşılık geldiği varsayılır .

Pseudomonas syringae DC3000'de RNA transkriptleri üzerinde yapılan deneyler , o organizmadaki iki gamma-150 RNA'nın ayrı RNA molekülleri olarak kopyalandığını ortaya çıkardı. Transkript uzunluğu kabaca 380 nükleotit boyutundadır ve bu, gamma-150 motifinin neredeyse iki katıdır. Sigma 54 olarak da adlandırılan bir protein olan RpoN tarafından yazılmaları muhtemeldir.

Yapısal olarak gamma-150 motifi, dört bağımsız gövde döngüsünden oluşur . İlk kök-ilmek (RNA'nın 5 'ucuna en yakın kök-ilmek), bir RNA olarak kimliğini desteklemek için önemli bir kovaryasyona sahiptir (bkz. İkincil yapı tahmini ). İkinci ve dördüncüsü daha mütevazı kanıtlara sahipken, üçüncü kök-döngü kötü korunmuş olabilir veya gerçek olmayabilir. RNA motifi boyunca nükleotid özdeşliğinin yüksek düzeyde korunmuş çeşitli bölgeleri mevcuttur ve birçoğu kısa adenozinler içerir .

Referanslar