Epstein–Barr virüsü kodlu küçük RNA'lar - Epstein–Barr virus-encoded small RNAs
| EBER1 | |
|---|---|
 EBER1'in korunmuş ikincil yapısı.
| |
| tanımlayıcılar | |
| Sembol | EBER1 |
| Rfam | RF01789 |
| Diğer veri | |
| RNA tipi | Gen |
| Alan(lar) | Epstein Barr Virüsü |
| PDB yapıları | PDBe |
Epstein-Barr virüsü kodlanmış küçük RNA'ların (Ebers) küçük kodlayıcı olmayan RNA'lar lokalize çekirdeği ile enfekte olmuş insan hücreleri , Epstein-Barr virüsü (EBV) bulunur. İlk olarak 1981'de keşfedilen EBER'ler, enfekte hücrelerde en bol bulunan RNA'lardır . EBER'ler, ribonükleoprotein (RNP) kompleksleri oluşturmak için birkaç konakçı proteinle etkileşime girer . Ebers için kesin bir işlevi belirsiz olmakla birlikte, roller de transformasyon ve tümör oluşması önerilmiştir.
Arka plan
EBER1 ve EBER2 kısa, sırasıyla 167 ve 172 nükleotit uzunluğunda, nükleer zenginleştirilmiş kodlamayan RNA'lardır . Bu iki RNA, EBV'nin latent enfeksiyonu sırasında konağın RNA polimeraz III tarafından kopyalanır .
EBER 1 ve 2, doğada hiçbir zaman silinmiş bulunmamış olsa da, fark edilir fenotipik değişiklikler olmaksızın viral genomdan silinebilir. Tek başına EBER ekspresyonu , şiddetli kombine immün yetmezlikli farelerde tümörleri indükleyebilir .
EBER1
EBER1 insan ile ilişkilendirir ribozomal protein L22 ve taşınmaya bu proteinin neden çekirdekçik için nükleolazma . EBER1 ayrıca en az üç ana bilgisayar hnRNP'si (A1, A2/B1 ve D/ AUF1 ) ile spesifik olarak etkileşime girer .
EBER2
EBER1'e benzer şekilde EBER2, latent olarak enfekte olmuş hücrelerde çok yüksek oranda eksprese edilir. EBER1'den farklı olarak, EBER2 dizisi ilgili herpes virüslerinde daha az korunur (~%50 koruma). Bununla birlikte, ikincil yapı EBER2 ait olan son derece (Şekil 1 e bakınız), korumalı. EBER2'nin yalnızca hücresel proteinleri (özellikle La alanı ) tekrarlanan üridinlerin terminal uzantısında bağladığı bilinmektedir ; bununla birlikte, EBER2'nin diğer özelliklerinin, özellikle iki uzun ve yüksek oranda korunmuş kök halkalarının , henüz bilinmeyen proteinler için bağlanma yerleri olarak da hizmet edebileceğine inanılmaktadır .