clpX - ClpX
ATP'ye bağımlı Clp proteaz ATP-bağlayıcı alt birim clpX benzeri mitokondriyal , insanlarda CLPX geni tarafından kodlanan bir enzimdir . Bu protein, AAA Proteinleri (AAA+ ATPaz) ailesinin bir üyesidir ve Clp proteazın ( Endopeptidaz Clp ) protein kompleksini oluşturur .
Yapı
Protein Yapısı
İnsan ClpX proteini bilgisi büyük ölçüde E. coli proteini üzerindeki araştırmalara dayanmaktadır . E. coli'deki ClpX proteininin monomeri , bir N-terminal alanı ve bir büyük ve bir küçük AAA+ alanından oluşan bir AAA+ modülü içerir.
Karmaşık Montaj
Proteaz Clp kompleksi montajı sırasında, ClpX alt birimleri bir heksamerik halka yapısı oluşturur. ClpX alt birimlerinin halka yapısı içindeki yönelimine göre, bu alt birimler iki sınıfa ayrılabilir: "yüklenebilir" alt birim (L alt birim) ve "yüklenebilir" alt birim (U alt birim). L alt biriminde, büyük ve küçük AAA+ alanı, nükleotid ATP veya ADP bağlanması için bir yarık oluşturur. Bununla birlikte, U alt birimindeki büyük ve küçük AAA+ alanları, nükleotit bağlanmasını önleyen ~80° döner. L ve U alt birimleri, maksimum dört ATP veya ADP bağlama kapasitesine sahip bir heksamerik halka halinde bir araya geldiklerinde bir "LLULLU" modeli oluştururlar. Elektro-mikroskopi (EM) çalışmaları, ClpX halka yapılarının, ClpXP proteaz kompleksleri oluşturmak için ClpP tetradecamer kompleksinin bir tarafında veya her iki tarafında eş eksenli olarak istiflendiğini göstermiştir. ATP bağlanması, ClpX ve ClpP halka yapıları arasındaki ilişkiyi stabilize edebilir.
Mikobakterilerde, ClpXP proteaz, ATPase bileşeninden (ClpX) ve iki ClpP proteininden (ClpP1 ve ClpP2) oluşur. İlginç bir şekilde, ATPase bileşeninin fıçı şeklindeki peptidaz bileşeninin her iki yüzüne de bağlandığı bilinen E. coli kompleksinin aksine , Mikobakterilerde ATPase bileşeni (ClpX) asimetrik bir şekilde kenetlenir, sadece bir tanesine bağlanır. ClpP1P2 kompleksinin yüzü - yani ClpP2
İşlev
ClpX, protein bozunma etiketlerine bağlanarak protein substratlarını tanıyabilen ATP'ye bağımlı bir şaperondur. Bu etiketler, kısa yapılandırılmamış peptit dizileri olabilir (örneğin, E coli'de ssrA-tag ). ClpP proteaz kompleksinin temel bir bileşeni olarak ClpX, bozunabilir substratları toplar ve ATP hidrolizi tarafından sağlanan enerjiyi gerektiren üçüncül yapılarını açar. Daha sonra, bu ClpX Şaperonları, protein substratlarını ClpP tetradecamer tarafından oluşturulan proteolitik bölmeye aktarır.
Klinik Önem
Memelilerde, ClpXP proteaz, mitokondriyal protein kalite kontrolüne çok önemli bir katkıda bulunur. Tehlikeli bir ClpXP işlevi, genellikle, nörodejeneratif hastalıklar ve yaşlanma için potansiyel nedenler olduğuna inanılan hasarlı proteinlerin ve mitokondriyal işlev bozukluklarının birikmesine yol açar.
Referanslar
 |
Bu protein, lı makale bir taslaktır . Vikipedi'yi genişleterek yardımcı olabilirsiniz . |